Das Rückspiel endete mit 1:0 für KS Vllaznia Shkodra. Die Partie wurde aber mit 3:0 für KS Vllaznia Shkodra gewertet, da Hapoel Be’er Scheva einen nicht berechtigten Spieler einsetzte.
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Das Hinspiel endete mit 4:0 für den SC Schwarz-Weiß Bregenz. Die Partie wurde aber mit 3:0 für Xəzər Universiteti Baki gewertet, da Bregenz 3 Jugendspieler auf der Bank hatte (von denen einer spielte), die nicht bei der UEFA registriert waren.
2. Runde
Die Hinspiele fanden am 3./4. Juli, die Rückspiele am 10./11. Juli 2004 statt.