Národní přírodní rezervace Krumlovsko-rokytenské slepence byla vyhlášena k ochraně přírodovědecky nejhodnotnější části geomorfologicky a mikroklimaticky členitého území údolí říčky Rokytné zahloubené v permských slepencích na jihovýchodním okraji Boskovické brázdy s výskytem druhově mimořádně bohatých rostlinných a živočišných společenstev skal, lesostepí, lesů a vodních toků. Mezi nejvýznamnější zástupce rostlin patří endemický hvozdík moravský (Dianthus moravicus), koniklec velkokvětý (Pulsatilla grandis) nebo řeřišničník skalní (Cardaminopsis petraea). Z bezobratlých je na lokalitě hojně zastoupena kudlanka nábožná (Mantis religiosa), dále se zde vyskytuje např. pestrokřídlec podražcový (Zerynthia polyxena), ploskoroh pestrý (Libelloides macaronius), krasec uherský (Anthaxia hungarica hungarica) či tesařík obrovský (Cerambyx cerdo Linné). V přirozeném úseku řeky Rokytné byl potvrzen výskyt kriticky ohroženého velevruba malířského (Unio pictorum). Z legislativně chráněných druhů plazů se v zájmovém území vyskytuje např. ještěrka zelená (Lacerta viridis), užovka hladká (Coronella austriaca), užovka obojková (Natrix natrix), z obojživelníků ropucha obecná (Bufo bufo), z avifauny např. strnad luční (Emberiza calandra), křepelka polní (Coturnix coturnix), sova pálená (Tyto alba), dudek chocholatý (Upupa epops), výr velký (Bubo bubo) nebo krkavec velký (Corvus corax).
Rezervaci tvoří dvě samostatná území, a to v okolí osady Rokytná a pod kostelem Sv. Floriana nad městem Moravský Krumlov v okrese Znojmo.
Podyjí
Jevišovka • Rokytná • Střední Pojihlaví
Krumlovsko-rokytenské slepence
Miroslavské kopce
Bílý kříž • Cornštejn • Karlov • Na Bítovské cestě • Na Kocourkách • Pod Havranem • Podhradské skály • Růžový vrch • Templštejn • Tisová stráň • U doutné skály
Bau • Bílá skála u Jamolic • Božický mokřad • Cínová hora • Čekal • Černice • Červený rybníček • Dyjské svahy • Fládnitzské vřesoviště • Hevlínské jezero • Horáčkův kopeček • Horecký kopec • Horní Karlov • Ječmeniště • Kadovská skála • Kamenná hora u Derflic • Kaolinka • Kopečky u Únanova • Lapikus • Lom u Žerůtek • Losolosy • Mašovický lom • Mikulovické jezero • Na propasti • Načeratický kopec • Oleksovická mokřina • Oleksovické vřesoviště • Orlí hnízdo • Pod Šibeničním kopcem • Petrovy skály • Protržený rybník • Pustý kopec u Konic • Rudlické kopce • Skalky u Havraníků • Spálená • Střebovský kopec • Stříbrný vrch • Šafářka • Šidlovy skalky • Široký • Štěpánovský lom • Tasovické svahy • Trávní dvůr • U Huberta • U kapličky • U Michálka • Uherčická louka • Ve Žlebě • Velký kopec • Vraní vrch • Vrbovecký rybník • Výrovické kopce • Zmijiště • Žleby