Transmembranski protein 69 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom TMEM69 sa hromosoma 1.[5] A notable feature of the protein encoded by TMEM69 is the presence of five transmembrane segments.[6]
| Pristupni broj
|
Lokacija
|
Identifikatori
|
M.W.
|
pI
|
| iRNK: NM_016486.3
protein: NP_057570.2 [5]
|
1p34.1
|
HSPC229, C1orf154, FLJ21029, LOC51249
|
27,6 kDa
|
10,3
|
Funkcija
Naučna zajednica još uvijek ne razumije tačnu funkciju TMEM69. Međutim, smatra se da ima ulogu proteina skele u kompleksu receptora prerađenog G-proteina u Xenopus tropicalis. Pokazalo se da formira klaster sa xtGPR54-2 genom IPP i GPBP1 u skeli_41.[7] Ovaj kompleks je dio G-protein spregnutog receptora koji djeluje kao receptor za vezivni ligand, kispeptin u plazmamembrani moždanih ćelija.[7]
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 247 aminokiselina, a molekulska težina 27.551 Da.
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MLRFIQKFSQ | | ASSKILKYSF | | PVGLRTSRTD | | ILSLKMSLQQ | | NFSPCPRPWL |
| SSSFPAYMSK | | TQCYHTSPCS | | FKKQQKQALL | | ARPSSTITYL | | TDSPKPALCV |
| TLAGLIPFVA | | PPLVMLMTKT | | YIPILAFTQM | | AYGASFLSFL | | GGIRWGFALP |
| EGSPAKPDYL | | NLASSAAPLF | | FSWFAFLISE | | RLSEAIVTVI | | MGMGVAFHLE |
| LFLLPHYPNW | | FKALRIVVTL | | LATFSFIITL | | VVKSSFPEKG | | HKRPGQV |
Protein
TMEM69 je dug 247 aminokiselina. Prisutno je pet transmembranskih segmenata, kao i domen nepoznate funkcije, DUF3429, koji obuhvata aminokiseline 91-232.[8]
![]()
Gen
Gen TMEM69, lociran na hromosomskoj regiji 1p34.1, pokrivajući 7,24 kb.[9] Nalazi se na plus lancu u genomskoj sekvenci od 46152886 do 46160121 i kodira primarni iRNK transkript koji sadrži tri egzona, a dužina je 6262 bp. Predviđeno je da gen TMEM69 kodira tri alternativna transkripta .[10]
Gensko susjedstvo
Predviđena svojstva
Svojstva TMEM69 koja su predviđena pomoću bioinformatučkih alata:
- Molekulska težina: 27,6 KDa.[9]
- Izoelektrična tačka: 10,3[14]
- Posttranslacijske modifikacije: Višestruka mjesta fosforilacije predviđena su iz NetPhos programa na ExPASy . NetPhos ih je predvidio sedam za aminokiselinu serin: na pozicijama 12, 27, 33, 85, 93, 183 i 234; jedno za treonin na poziciji 26 i dva za tirozin: na pozicijama 57 i 159.[15] NetGlyc na ExPASy je predvidio pet glikacijskih mjesta na pozicijama 7, 60, 73, 156 i 239.
- [[transmembranski domen|Transmembranski segmenti: TMEM69 sadrži pet transmembranskih regiona koji se nalaze na pozicijama 97–117, 122–142, 159–179, 185–205 i 216–236.[16]
Ekspresija
TMEM69 se eksprimira sveprisutno na niskim nivoima u cijelom ljudskom tijelu, iako podaci EST profila otkrivaju da je TMEM69 posebno izražen u neuroendokrinim tkivima kao što su jetra, amigdala, hipokampus i hipotalamus.[17] Utvrđeno je da je TMEM69 eksprimiran u vrijednostima nižim od normalnih kod pacijenata koji pate od ateroskleroze.[18]
Homologija
Ortolozi
Gen TMEM69 duboko je očuvan u nekoliko životnih oblika. Iako pokazuje najveću očuvanost među ortolozima sisavaca, zajedno s drugim hordati kao što su ribe, ptice i vodozemci, postoji određena očuvanost kod biljaka, insekata, gljiva i bakterija.[8]
Paralozi
Nisu pronađeni paralozi za TMEM69.
Konzerviranost
TMEM69 je dobro konzerviran u različitim organizmima. Iako se većina ortologa nalazi kod placentnih sisara, neki ortolozi se nalaze u bakterijama i gljivama. Najudaljeniji ortolog za koji je utvrđeno da ima sličnost sekvence sa TMEM69 je Pseudomonas putida W619, koja je vrsta zemljišne bakterije.[19] Posebno dobro konzerviran čak i kod najudaljenijih ortologa, uključujući Pseudomonas putida W619, najveći je dio drugog transmembranski domen|transmembranskog segmenta]] TMEM69. U strogim ortolozima svih pet transmembranskih domena je očuvano.[20] Konzervirani domeni pronađeni unutar TMEM69, dio su DUF3429, porodice nekarakterističnih proteina pronađenih u bakterijama i eukariotima.[8]
Reference
Ovaj članak uključuje tekst iz Nacionalne medicinske biblioteke Sjedinjenih Država, koji je u javnom vlasništvu.
