PROFILBARU.COM

SRRM1
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتين	Ortholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين
	1MP1
معرفات
أسماء بديلة	SRRM1, 160-KD, POP101, SRM160, serine and arginine repetitive matrix 1
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 605975 MGI: MGI:1858303 HomoloGene: 136796 GeneCards: 10250
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية	• ربط دي إن إي; • ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني; • RNA binding;
مكونات خلوية	• مصفوفة نووية; • عصارة خلوية; • catalytic step 2 spliceosome; • spliceosomal complex; • نواة; • بلازم نووي; • nuclear speck;
عمليات حيوية	• RNA splicing, via transesterification reactions; • mRNA splicing, via spliceosome; • termination of RNA polymerase II transcription; • mRNA processing; • mRNA 3'-end processing; • mRNA export from nucleus; • تضفير الآر أن إيه; • RNA export from nucleus;
	المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
	; ;
	المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
	Q8IYB3
	Q52KI8
	‏NM_001303449، ‏NM_005839، ‏XM_005245717، ‏XM_005245718، ‏XM_005245720، ‏XM_005245721، ‏XM_005245722، ‏XM_011540478، ‏XM_011540479، ‏XM_011540480، ‏XM_011540481، ‏XM_011540482، ‏XM_011540483، ‏XM_017000011، ‏XM_017000012، ‏XM_017000013، ‏XM_017000014، ‏XM_017000015، ‏XM_017000016، ‏XM_017000017، ‏XM_017000018، ‏XM_017000019، ‏XM_017000020، ‏XM_017000021، ‏XM_017000022، ‏XM_017000023، ‏XM_017000024، ‏XM_017000025، ‏XM_017000026، ‏XM_017000027، ‏XM_017000028، ‏XM_017000029، ‏XM_017000030، ‏XM_017000031، ‏XM_017000032، ‏XM_017000033، ‏XM_017000034، ‏XR_001736902، ‏XR_001736903، ‏XR_001736904، ‏XR_001736905، ‏XM_024449353 NM_001303448، ‏NM_001303449، ‏NM_005839، ‏XM_005245717، ‏XM_005245718، ‏XM_005245720، ‏XM_005245721، ‏XM_005245722، ‏XM_011540478، ‏XM_011540479، ‏XM_011540480، ‏XM_011540481، ‏XM_011540482، ‏XM_011540483، ‏XM_017000011، ‏XM_017000012، ‏XM_017000013، ‏XM_017000014، ‏XM_017000015، ‏XM_017000016، ‏XM_017000017، ‏XM_017000018، ‏XM_017000019، ‏XM_017000020، ‏XM_017000021، ‏XM_017000022، ‏XM_017000023، ‏XM_017000024، ‏XM_017000025، ‏XM_017000026، ‏XM_017000027، ‏XM_017000028، ‏XM_017000029، ‏XM_017000030، ‏XM_017000031، ‏XM_017000032، ‏XM_017000033، ‏XM_017000034، ‏XR_001736902، ‏XR_001736903، ‏XR_001736904، ‏XR_001736905، ‏XM_024449353
	‏NM_016799، ‏XM_006539026، ‏XM_006539027، ‏XM_006539028، ‏XM_006539029، ‏XM_006539030، ‏XM_006539031، ‏XM_006539032، ‏XM_006539033، ‏XM_011250301، ‏XM_017320313، ‏NM_001369067، ‏NM_001369068، ‏NM_001369069، ‏NM_001369070، ‏NM_001369071، ‏NM_001369072، ‏NM_001369073، ‏NM_001369074 NM_001130477، ‏NM_016799، ‏XM_006539026، ‏XM_006539027، ‏XM_006539028، ‏XM_006539029، ‏XM_006539030، ‏XM_006539031، ‏XM_006539032، ‏XM_006539033، ‏XM_011250301، ‏XM_017320313، ‏NM_001369067، ‏NM_001369068، ‏NM_001369069، ‏NM_001369070، ‏NM_001369071، ‏NM_001369072، ‏NM_001369073، ‏NM_001369074
	‏NP_001290378، ‏NP_005830، ‏XP_011538782، ‏XP_016855500، ‏XP_016855501، ‏XP_016855502، ‏XP_016855503، ‏XP_016855504، ‏XP_016855506، ‏XP_016855521، ‏XP_016855523، ‏XP_024305121، ‏NP_001353494، ‏NP_001353495، ‏NP_001353496، ‏NP_001353497، ‏NP_001353498، ‏NP_001353499، ‏NP_001353500، ‏NP_001353501، ‏NP_001353502، ‏NP_001353504، ‏NP_001353505، ‏NP_001353506، ‏NP_001353507، ‏NP_001353510، ‏NP_001353511، ‏NP_001353513، ‏NP_001353514، ‏NP_001353515، ‏NP_001353516، ‏NP_001353517، ‏NP_001353518، ‏NP_001353519، ‏NP_001353520، ‏NP_001353521، ‏NP_001353522، ‏NP_001353523، ‏NP_001353524، ‏NP_001353525، ‏NP_001353526، ‏NP_001353527، ‏NP_001353528، ‏NP_001353529 NP_001290377، ‏NP_001290378، ‏NP_005830، ‏XP_011538782، ‏XP_016855500، ‏XP_016855501، ‏XP_016855502، ‏XP_016855503، ‏XP_016855504، ‏XP_016855506، ‏XP_016855521، ‏XP_016855523، ‏XP_024305121، ‏NP_001353494، ‏NP_001353495، ‏NP_001353496، ‏NP_001353497، ‏NP_001353498، ‏NP_001353499، ‏NP_001353500، ‏NP_001353501، ‏NP_001353502، ‏NP_001353504، ‏NP_001353505، ‏NP_001353506، ‏NP_001353507، ‏NP_001353510، ‏NP_001353511، ‏NP_001353513، ‏NP_001353514، ‏NP_001353515، ‏NP_001353516، ‏NP_001353517، ‏NP_001353518، ‏NP_001353519، ‏NP_001353520، ‏NP_001353521، ‏NP_001353522، ‏NP_001353523، ‏NP_001353524، ‏NP_001353525، ‏NP_001353526، ‏NP_001353527، ‏NP_001353528، ‏NP_001353529
	‏NP_058079، ‏XP_006539089، ‏XP_006539092، ‏XP_006539095، ‏XP_006539096، ‏XP_017175802، ‏NP_001355996، ‏NP_001355997، ‏NP_001355998، ‏NP_001355999، ‏NP_001356000، ‏NP_001356001، ‏NP_001356002، ‏NP_001356003، ‏XP_030109517، ‏XP_030109518، ‏XP_030109519، ‏XP_030109520، ‏XP_030109521، ‏XP_030109522، ‏XP_030109523، ‏XP_030109524، ‏XP_030109525، ‏XP_030109526، ‏XP_030109527، ‏XP_030109528، ‏XP_030109529، ‏XP_036020122، ‏XP_036020123، ‏XP_036020124، ‏XP_036020125 NP_001123949، ‏NP_058079، ‏XP_006539089، ‏XP_006539092، ‏XP_006539095، ‏XP_006539096، ‏XP_017175802، ‏NP_001355996، ‏NP_001355997، ‏NP_001355998، ‏NP_001355999، ‏NP_001356000، ‏NP_001356001، ‏NP_001356002، ‏NP_001356003، ‏XP_030109517، ‏XP_030109518، ‏XP_030109519، ‏XP_030109520، ‏XP_030109521، ‏XP_030109522، ‏XP_030109523، ‏XP_030109524، ‏XP_030109525، ‏XP_030109526، ‏XP_030109527، ‏XP_030109528، ‏XP_030109529، ‏XP_036020122، ‏XP_036020123، ‏XP_036020124، ‏XP_036020125
	ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان	اعرض/عدّل فأر

SRRM1‏ (Serine and arginine repetitive matrix 1) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين SRRM1 في الإنسان.^[1]^[2]

الوظيفة

الأهمية السريرية

المراجع

^ Blencowe BJ، Issner R، Nickerson JA، Sharp PA (مايو 1998). "A coactivator of pre-mRNA splicing". Genes Dev. ج. 12 ع. 7: 996–1009. DOI:10.1101/gad.12.7.996. PMC:316672. PMID:9531537.
^ "Entrez Gene: SRRM1 serine/arginine repetitive matrix 1". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.

قراءة متعمقة

Wang HY، Lin W، Dyck JA، Yeakley JM، Songyang Z، Cantley LC، Fu XD (1998). "SRPK2: a differentially expressed SR protein-specific kinase involved in mediating the interaction and localization of pre-mRNA splicing factors in mammalian cells". J. Cell Biol. ج. 140 ع. 4: 737–50. DOI:10.1083/jcb.140.4.737. PMC:2141757. PMID:9472028.
Wilson KF، Fortes P، Singh US، Ohno M، Mattaj IW، Cerione RA (1999). "The nuclear cap-binding complex is a novel target of growth factor receptor-coupled signal transduction". J. Biol. Chem. ج. 274 ع. 7: 4166–73. DOI:10.1074/jbc.274.7.4166. PMID:9933612.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Eldridge AG، Li Y، Sharp PA، Blencowe BJ (1999). "The SRm160/300 splicing coactivator is required for exon-enhancer function". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 96 ع. 11: 6125–30. DOI:10.1073/pnas.96.11.6125. PMC:26846. PMID:10339552.
Blencowe BJ، Baurén G، Eldridge AG، Issner R، Nickerson JA، Rosonina E، Sharp PA (2000). "The SRm160/300 splicing coactivator subunits". RNA. ج. 6 ع. 1: 111–20. DOI:10.1017/S1355838200991982. PMC:1369899. PMID:10668804.
Le Hir H، Moore MJ، Maquat LE (2000). "Pre-mRNA splicing alters mRNP composition: evidence for stable association of proteins at exon-exon junctions". Genes Dev. ج. 14 ع. 9: 1098–108. PMC:316578. PMID:10809668.
McGarvey T، Rosonina E، McCracken S، Li Q، Arnaout R، Mientjes E، Nickerson JA، Awrey D، Greenblatt J، Grosveld G، Blencowe BJ (2000). "The acute myeloid leukemia-associated protein, DEK, forms a splicing-dependent interaction with exon-product complexes". J. Cell Biol. ج. 150 ع. 2: 309–20. DOI:10.1083/jcb.150.2.309. PMC:2180225. PMID:10908574.
Le Hir H، Izaurralde E، Maquat LE، Moore MJ (2000). "The spliceosome deposits multiple proteins 20-24 nucleotides upstream of mRNA exon-exon junctions". EMBO J. ج. 19 ع. 24: 6860–9. DOI:10.1093/emboj/19.24.6860. PMC:305905. PMID:11118221.
Lykke-Andersen J، Shu MD، Steitz JA (2001). "Communication of the position of exon-exon junctions to the mRNA surveillance machinery by the protein RNPS1". Science. ج. 293 ع. 5536: 1836–9. DOI:10.1126/science.1062786. PMID:11546874.
McCracken S، Lambermon M، Blencowe BJ (2002). "SRm160 splicing coactivator promotes transcript 3'-end cleavage". Mol. Cell. Biol. ج. 22 ع. 1: 148–60. DOI:10.1128/MCB.22.1.148-160.2002. PMC:134228. PMID:11739730.
Szymczyna BR، Pineda-Lucena A، Mills JL، Szyperski T، Arrowsmith CH (2002). "1H, 13C, and 15N resonance assignments and secondary structure of the PWI domain from SRm160 using reduced dimensionality NMR". J. Biomol. NMR. ج. 22 ع. 3: 299–300. DOI:10.1023/A:1014904502424. PMID:11991360.
Jurica MS، Licklider LJ، Gygi SR، Grigorieff N، Moore MJ (2002). "Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis". RNA. ج. 8 ع. 4: 426–39. DOI:10.1017/S1355838202021088. PMC:1370266. PMID:11991638.
Lejeune F، Ishigaki Y، Li X، Maquat LE (2002). "The exon junction complex is detected on CBP80-bound but not eIF4E-bound mRNA in mammalian cells: dynamics of mRNP remodeling". EMBO J. ج. 21 ع. 13: 3536–45. DOI:10.1093/emboj/cdf345. PMC:126094. PMID:12093754.
Meissner M، Lopato S، Gotzmann J، Sauermann G، Barta A (2003). "Proto-oncoprotein TLS/FUS is associated to the nuclear matrix and complexed with splicing factors PTB, SRm160, and SR proteins". Exp. Cell Res. ج. 283 ع. 2: 184–95. DOI:10.1016/S0014-4827(02)00046-0. PMID:12581738.
Szymczyna BR، Bowman J، McCracken S، Pineda-Lucena A، Lu Y، Cox B، Lambermon M، Graveley BR، Arrowsmith CH، Blencowe BJ (2003). "Structure and function of the PWI motif: a novel nucleic acid-binding domain that facilitates pre-mRNA processing". Genes Dev. ج. 17 ع. 4: 461–75. DOI:10.1101/gad.1060403. PMC:196000. PMID:12600940.
Wagner S، Chiosea S، Nickerson JA (2003). "The spatial targeting and nuclear matrix binding domains of SRm160". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 100 ع. 6: 3269–74. DOI:10.1073/pnas.0438055100. PMC:152281. PMID:12624182.
McCracken S، Longman D، Johnstone IL، Cáceres JF، Blencowe BJ (2003). "An evolutionarily conserved role for SRm160 in 3'-end processing that functions independently of exon junction complex formation". J. Biol. Chem. ج. 278 ع. 45: 44153–60. DOI:10.1074/jbc.M306856200. PMID:12944400.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Wagner S، Chiosea S، Ivshina M، Nickerson JA (2004). "In vitro FRAP reveals the ATP-dependent nuclear mobilization of the exon junction complex protein SRm160". J. Cell Biol. ج. 164 ع. 6: 843–50. DOI:10.1083/jcb.200307002. PMC:2172284. PMID:15024032.
Brill LM، Salomon AR، Ficarro SB، Mukherji M، Stettler-Gill M، Peters EC (2004). "Robust phosphoproteomic profiling of tyrosine phosphorylation sites from human T cells using immobilized metal affinity chromatography and tandem mass spectrometry". Anal. Chem. ج. 76 ع. 10: 2763–72. DOI:10.1021/ac035352d. PMID:15144186.