شارك في هذه المرحلة 40 منتخب، 34 تأهلت لها تلقائيا، و 6 منتخبات تأهلت من المرحلة الاولى.تم تقسيم المنتخبات إلى ثمانية مجموعات، كل مجموعة من خمسة منتخبات لخوض مباريات الذهاب والإياب، بمجموع ثمانية مباريات لكل منتخب. لعبت طاجيكستان في المجموعة السادسة وحلت بالترتيب الثاني بعد اليابان التي تصدرت المجموعة.
تنافس 24 منتخب (22 منتخب تأهلوا من الدور الثاني ومنتخبان سيتأهلان من الدور التمهيدي ) في الدور الثالث للتنافس على المقاعد الإحدى عشر المتبقية في كأس آسيا 2023. تم تقسيم المنتخبات إلى ستة مجموعات من أربعة فرق للعب ثلاثة مباريات لكل منتخب. لعبت طاجيكستان في المجموعة السادسة التي ضمت ايضا قيرغيزستان وسنغافورةوميانمار. وتصدرت المجموعة لتتأهل لكاس اسيا لاول مرة.
خاض منتخب طاجيكستان 5 مباريات في اول مشاركة حيث تأهل للدور الثاني وفاز على منتخب الامارات بركلات الترجيح،[ar 2] للدور ربع النهائي من البطولة وخسر أمام منتخب الأردن.[ar 3]