Paixão berasal dari negara bagian barat. Ketika Indonesia menduduki negara tetangganya, Timor Timur pada tahun 1975, Paixão bergabung dengan perlawanan bersenjata FALINTIL . Dia adalah komandan kompi di Liquiçá, komandan kemudian dari sektor perlawanan Fronteira Norte. Ketika situasi menjadi terlalu kritis dan terancam mati karena sakit dan kelaparan, Paixão menghubungi pasukan Indonesia di Fatubessi. Pada 7 Februari 1979, sebagian besar militer dan sipil, para pemimpin Timor Leste Fronteira Norte menyerah kepada Batalyon Indonesia.[2] Di lingkungan Kunjungan Paus Yohanes Paulus II ke Timor Leste secara dini menahan potensi para pelaku militer Indonesia untuk mencegah demonstrasi kemerdekaan. Di antara mereka ada lagi Paixão, yang ditangkap pada Juni 1990 dan dibawa ke pangkalan militer di Dili.[3]
Untuk memperoleh kembali kemerdekaan pada 2002, FALINTIL dipindahkan dari 1999 ke pasukan baru Timor Timur, di bawah pengawasan Perserikatan Bangsa-Bangsa. Sejak 1 Februari 2001 Paixao memegang pangkat letnan kolonel. 2008 Paixão adalah kepala Operasi Halibur dan menerima penyerahan pemimpin pemberontak Gastão Salsinha.[4] Sebagai 14 Januari 2009 adalah seorang kolonel Paixão (Coronel) dan komandan angkatan bersenjata. Pada tahun 2010 ia menjadi Kepala Staf (Chefe de Estado-Maior).[5] Pada tanggal 6 Oktober 2011 ia dipromosikan menjadi brigadir komandan umum dan wakil dari angkatan bersenjata.
Pada tanggal 9 Februari 2015, PresidenTaur Matan Ruak menunjuk Paixão sebagai panglima militer baru F-FDTL menggantikan Lere Anan Timur. Namun, ini bertemu dengan perlawanan dari pemerintah dan parlemen, yang menyerukan perpanjangan masa jabatan Lere Anan Timur karena hak mereka untuk mengusulkan.[6] Akhirnya, kesepakatan dicapai pada tanggal 15 April, pada pencalonan Pedro Klamar Fuik sebagai kepala staf baru. Sampai serah terima, Lere Anan Timor harus terus memimpin. Setelah itu, dia dan Paixo harus pensiun atau bergabung dengan cadangan.[7][8] Namun, pergantian jabatan itu tidak terjadi selama masa jabatan Presiden Taur Matan Ruak. Pada Oktober 2015, pemerintah merekomendasikan perpanjangan masa jabatan Lere Anan Timur dan Filomeno Paixão.[9] Ini adalah Paixão masa jabatan ketiga, yang tidak benar-benar disediakan oleh hukum yang berlaku. Menyusul aksesi Kabinet Pemerintah Konstitusional Ketujuh, Presiden Francisco Guterres mengikuti usulan Perdana Menteri Alkatiri dan pada tanggal 5 Oktober 2017 memperpanjang masa jabatan Filomeno Paixão dan kepemimpinan FDTL yang ada selama satu tahun lagi, yang berarti sebuah amendemen baru terhadap hukum militer.[10][11]
Pada tahun 2018 Paixão dinominasikan sebagai Menteri Pertahanan Timor Leste Kabinet Pemerintah Konstitusional Kedelapan, yang mengapa ia menyerahkan kepergiannya dari F-FDTL.[12][13] Namun, dia absen dari upacara pelantikan pada 22 Juni. Ada masalah administrasi. Pemecatan resmi sebagai wakil komandan secara administratif belum selesai. Meskipun pemecatan bisa diucapkan oleh Presiden, tetapi hanya atas permintaan pemerintah, yang hilang.[5][14][15] Pada tanggal 5 Juli, Presiden Guterres mengangkat Menteri Pertahanan Paixão[16] dan dilantik pada tanggal 9 Juli.[1] Ia menjabat sebagai menteri hingga berakhirnya masa legislatif pada 30 Juni 2023.
Keluarga
Paixão adalah putra Miguel Faria de Jesus dan Norberta Ximenes de Jesus. Filomeno Paixão menikah dengan Maria José doe Mártieres de Carvalho. Pasangan itu memiliki lima anak.[1]