蘑菇 是一種真菌有性生殖的結構真菌學 （Mycology ，源自希臘文μύκης ）是研究真菌 的學門，探討真菌的遺傳學 、生物化學 或是分類學 ，以及真菌 對人類的用途等，包括火種 医药 （如青霉素 ）、食物（如蘑菇 、奶酪 及酒 ）及宗教致幻劑 等，以及它們的危險，如中毒 或感染 。專門從事真菌學研究的生物學家被稱為真菌學家 （Mycologist ）。
研究植物病害的學門植物病理學 是真菌學的分支領域之一，絕大多數的植物病原體皆是真菌。
在历史上，真菌學是植物學 的一個分支，這是因為真菌 曾經被歸類為植物 。現在已知真菌演化 上的親緣關係較接近的是動物而不是植物，直到幾十年前這是未被識別的。先驅真菌學家包括伊利阿斯·马格努斯·弗里斯 ，克里斯蒂安·亨德里克·珀森 ，Heinrich Anton de Bary，Elizabeth Eaton Morse，Lewis David de Schweinitz等。《小兔彼得的故事 》的作者碧雅翠絲·波特 也對該領域做出了重大貢獻[ 1]
許多真菌產生毒素 ，抗生素 和其他次生代謝產物 。例如，Abraham Joffe 廣泛研究了世界分布 的鐮孢菌屬 及其與人類致命性消化道毒性白斑病爆發相關的毒素[ 2]
真菌在地球上的生命中作为它们的共生 生物的角色中是基本的，例如以菌根 的形式，昆虫 共生，和地衣 。许多真菌能够分解复杂的有机 生物分子 ，例如在木材 中的更持久成分木质素 ，和污染物，例如异生物质 石油 ，和多环芳香烃 。通过分解这些分子，真菌在全球碳循环 中起到关键作用。
某些真菌能够引起人类或其他生物 的疾病。致病真菌 的研究稱為醫用真菌學（medical mycology）。[ 3]
幾個世紀以來，某些蘑菇 在中國 、日本 和俄羅斯 已被記錄為民間藥物 [ 4] 中東 、波蘭 和白俄羅斯 ）的人們也有將蘑菇用於藥用的記錄[ 5]
蘑菇在暴露於紫外線 (UV) 時會產生大量維生素D [ 6] 青黴素 、環孢素 、灰黃黴素 、頭孢菌素 和裸蓋菇素 是從黴菌 或其他真菌中分離出來的藥物的例子[ 7]
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Elias Magnus Fries, Systema mycologicum (1821) [1] （页面存档备份 ，存于互联网档案馆 ）
Hawksworth, D. L. Mycologist's Handbook. (1974) Kew: U.K., CAB International.
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