《洛克人X6》（日版名：ロックマンX6，Rockman X6，英文版名：Mega Man X6）是電視遊戲洛克人X系列主軸故事的第6作。
西格瑪將太空殖民地「歐拉西亞」引下地球並墜落。艾克斯與傑洛一同力戰西格瑪，最後傑洛和西格瑪互相向對方放出致命一擊。大難不死的艾克斯手持好友的Z光束劍，繼續守護地球的和平和幫助進行復興計劃。災難過後，地上的環境變得荒蕪，人類亦轉到地下居住，由雷普利機器人和重工型機器人負責重建工作。
「歐拉西亞」墜落處旁的沙漠上，站著一位穿著白袍的雷普利機器人──凱特，對這太空殖民地的廣大遺跡感到好奇的同時，他發現了一塊與別不同旳碎片，因此決定把它帶回研究所分析。一星期後，凱特在研究所中發現該碎片擁有巨大力量，並開始加以利用。
「歐拉西亞事件」後三個星期，休息中的艾克斯夢見了傑洛並告訴他地球即將有危機出現。此時警報大響，艾克斯被艾莉亞叫醒，到「歐拉西亞」墜落處阻止一部故障的重工型機械。並配戴衝刺性能尚未修復的獵鷹鎧甲、傑洛的遺物－Z光束劍並前往地點。該巨型作業機械被打敗後發生爆炸，說時遲那時快，一個與傑洛極之相似的紫色身影降臨於艾克斯的面前，一劍將那機械的殘骸斬至粉碎，並一言不發地離開現場。艾克斯與艾莉亞不敢相信剛才發生的事，但危機又再次迫近。一名自稱海馬克斯的神秘雷普利機器人緊隨紫色的傑洛到場，艾克斯不滿他重傷傑洛為一夢魘（Nightmare），並且挑起戰鬥。海馬克斯的能力強大，他將艾克斯置之不理，亦叫艾克斯不要插手。
及後不久，凱特的助手艾索克發表公開演說，聲稱「夢魘」現象日益瀕繁，而傑洛的出現是當中的因由，有見及此，凱特將會建立一個脫離「夢魘」的國度，並且派出八位調查員去搜集「夢魘傑洛」的資料。艾克斯對凱特的動機深感懷疑，決定闖進調查區域調查這場陰謀。
由凱特在「歐拉西亞」遺跡發現的「傑洛DNA」殘骸，並研發製造的混亂病毒（可能與傑洛病毒有相似關係），並共分為以下幾種：
在傳送地區的第一戰中，艾克斯成功打敗夢魘傑洛，而真的傑洛亦再次出現於艾克斯的面前。傑洛說自己在生死一戰後匿藏了一會作自我修復，在與艾克斯短時間地重聚後，他再次返回獵人基地迎擊凱特的調查員。
8位惡夢現象調查隊隊員被擊敗，使獵人們了解夢魘病毒和凱特有密切的關係，或者，海馬克斯於亞空間的第二戰中戰敗，引起艾索克阻止傑洛的進攻的話，凱特便會向獵人基地作出通訊，與艾克斯和傑洛繼續抗爭，並自信地開放自身的地點，歡迎他倆進入「聖地」──「秘密研究所」。
打敗「秘密研究所」第一關的「夢魘之母」後，艾克斯和傑洛終於與凱特作近距離接觸。艾克斯和傑洛說要阻止凱特的陰謀；艾莉亞反對凱特的做法，並且不希望再作無謂的戰爭；席格那斯辯說人類與思考型機械人各有所缺，兩者皆不能獨自存活；凱特則堅持「夢魘」才可以為思考型機械人帶來一完美的國度，拿出那塊在沙漠中的碎片，並說出其真正面目──含有傑洛DNA的碎片！海馬克斯和夢魘病毒的出處！
兩位獵人立即繼續闖入「秘密研究所」以停止凱特再使用這危險的物件，而強化改良後的海馬克斯再一次被打敗後，凱特現身進行「最後的測試」，變身成金色盔甲的戰鬥形態。儘管是動用了傑洛的DNA，凱特也遭打敗，但他仍然留有後者──復活不完全的西格瑪。尚未完全復活的西格瑪視凱特為障礙，向他發出一炮重擊。兩人走向研究所的最後地帶，再次把諸惡之根源消滅……