M 98系統是由用作系統護罩的机匣和槍栓組件所組成,而後者的槍栓本體以上具有三個鎖耳,分別是在槍栓頭以上設有的兩個較大的主要鎖耳,以及在槍栓後部裝有的第三個保險凸耳,用以在主要鎖耳發生故障時用作備用。第三個鎖耳是該槍一個獨特的功能,以前的毛瑟栓動式槍機設計當中都無這個鎖耳。兩個主鎖耳的鎖緊面積為56平方毫米,而第三個保險鎖耳通常在槍機閉鎖方面並無任何作用,以避免造成不對稱的槍栓推力(英语:Bolt thrust)。M 98機匣的直徑亦比過去的毛瑟機匣有所擴大,以提高強度和安全性。拉機柄永久固定在槍栓以上,而且在毛瑟M 98系列以上為向下折轉,以配合光學瞄準鏡的使用。
M 98系統的另一個顯著特徵是約束式子彈供彈機構,由大型、不旋轉爪狀抽殼鈎所組成,當一發子彈離開彈匣以後,直到由安裝在機匣內部的拋殼挺將該彈彈出以前,抽殼鈎都會與彈殼底緣接合並且一直牢牢地抓住彈殼。加上在槍栓開放週期的最後階段、由於後機匣橋以上的凸輪表面所引發的輕微槍栓縮回,結果使得彈殼可以輕易抽出來。在槍機循環過程當中,無論步槍的活動或是定位方式如何,或者子彈是擊發了與否,M 98步槍的槍栓都將正確地進行循環。在約束式子彈供彈栓動式槍機當中,只有在槍栓拉得不夠遠,而且不夠銳利時,才有可能無法將彈殼乾淨地拋出,並且可能因而導致卡彈。
M 98的標準槍管長度為600毫米(23.62英寸),而M 98麥格農型的則是620毫米(24.41英寸)。M 98和M 98 麥格農型號可根據要求提供其他槍管長度,視情況而定。還有一種選擇,可以訂購裝有整體式槍管的步槍。這是一根具有四分之一肋條、瞄準鏡基座和由堅固的槍管坯料所加工而成的槍背帶(英语:Sling (firearms))環裝置的槍管。
供彈
M 98系統的內置式彈匣由一具整體式匣子所組成,而該匣子經過加工以與所裝填的步槍彈藥相匹配,並且裝有可拆卸式底板,可容納多達5發標準尺寸的步槍彈藥。彈匣可通過將每發子彈機匣頂部的開口推入,直到將其裝滿。彈匣可以通過操作槍栓(出於保險原因,為此建議將保險設置在中間位置)或是在發生機械問題的情況下、藉由打開底板以卸下。毛瑟M 98的內置式彈匣的標準口徑容量為5+1發,而麥格農口徑則是4+1發。