上天草市（日语：上天草市／かみあまくさし Kamiamakusa shi */?）為日本熊本縣天草群島東部的城市，位於聯繫有明海與八代海的通道上，也是天草群島前往九州的樞紐。境內平地不多，僅大矢野島上有地勢較緩的丘陵地[1]。
市內60.8%的面積被山林覆蓋，10.9％為田地，5.2％則為住宅用地。轄區主要島嶼包括大矢野島、上島（部份）、樋島與維和島。
由於上天草地區位於有明海與八代海之間的通道上，自古就是由被以海維生的人所控制。[2]島原之亂後，天草群島全部成為幕府直轄領，並設置富岡代官所進行管理。1868年8月，天草群島再改由長崎府管轄。1871年，天草群島被納入八代縣，之後改隸屬白川縣及熊本縣。