Народився 19 вересня1943 року в Ак-Булаку в сьогоднішньому Казахстані. Сім'я Кондратюка походила з Пінську, звідки її після окупації Польщі депортували до Казахстану, де народився Януш. У 1945 році родині було дозволено виїхати з Казахстану, але оскільки їхнє рідне місто Пінськ опинилось після війни на анексованій Радянським Союзом території, сім'я переїхала до Лодзі. У 1969 році закінчив режисуру на Кіношколу у Лодзі. У 1973 році він отримав нагороду «Золотий екран», а в 1993 році режисерську премію за фільм «Голос» на Фестивалі польської телевізійної творчості.
Він був молодшим братом режисера Анджея Кондратюка. Його дружиною була актриса Ева Шикульська
.jpg)
