«Кристал» виключений зі змагань згідно з рішенням Ради ліг від 10 квітня 2017 року, в усіх матчах, починаючи з 21-го туру, команді зараховані технічні поразки −:+.
Позначення:
клуби, що вийшли до першої ліги
участь у стикових матчах
клуби, що залишили другу лігу
Стикові матчі
За підсумками сезону команда, що посіла 4-е місце в другій лізі, виборює право на підвищення в класі з командою, що посіла 15-е місце в першій лізі. Жеребкування послідовності проведення матчів відбулося 3 червня 2017 року.[9]
ПФК «Суми» зберігає місце в першій лізі, а «Балкани» — у другій. Перед початком наступного чемпіонату через те, що ФК «Дніпро» за рішенням ФІФА відправлений до другої ліги, «Балкани» підвищилися у класі.