У змаганні брали участь всі 16 команд Прем'єр-ліги. Кубок проводився за системою з вибуванням, в кожному раунді команди грали по два матчі. Кількість замін у матчі було збільшено до п'яти.[1] Переможець Кубка не отримував права участі в Кубку УЄФА, а матчі проходили в дні матчів збірної, тому більшість клубів виставляли на матчі резервні склади. Змагання не користувалося популярністю, і в наступному сезоні РФПЛ відмовилася від його проведення, пославшись на «високу щільність матчів чемпіонату Росії і пріоритетним значенням інтересів національної збірної»[2].
У «Торпедо-Металург» протягом семи місяців не виплачувалась зарплата, і клуб проводив обидві гри в гостях на резервному полі в Черкізово. «Крила Рад» і «Ротор» двічі грали у Волгограді через те, що в Самарі перестилали газон. Московський «Спартак» приймав «Сатурн» на тренувальному полі у Тарасівці на базі без трибун[1].
Перші матчі відбулись 29 березня, а матчі-відповіді — 1 і 2 квітня 2003 року.