Третій розіграш Кубку Греції 1938—1939 відбувся після шестирічної перерви для реорганізації турніру. Усього брали участь 67 клубів. Фінальний матч зіграли 28 травня 1939 на афінському стадіоні «Апостолос Ніколаїдіс». Столичний клуб АЕК зустрівся зі ПАОК і виграв зі рахунком 2:1.
1 Цей матч був припинений на 40 хвилині.