SPP1

SPP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3CXD, 3DSF
Ідентифікатори
Символи	SPP1, BNSP, BSPI, ETA-1, OPN, secreted phosphoprotein 1, Osteopontin
Зовнішні ІД	OMIM: 166490 MGI: 98389 HomoloGene: 20156 GeneCards: SPP1
Онтологія гена Молекулярна функція • cytokine activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • extracellular matrix binding Клітинна компонента • cell projection • extracellular region • perinuclear region of cytoplasm • екзосома • міжклітинний простір • комплекс Ґольджі • везикула • endoplasmic reticulum lumen Біологічний процес • диференціація клітин • response to vitamin D • осифікація • biomineral tissue development • response to steroid hormone • extracellular matrix disassembly • extracellular matrix organization • response to organic substance • negative regulation of collateral sprouting of intact axon in response to injury • decidualization • inflammatory response • embryo implantation • osteoblast differentiation • positive regulation of bone resorption • адгезія клітин • androgen catabolic process • посттрансляційна модифікація • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to testosterone stimulus • positive regulation of estradiol secretion • regulation of signaling receptor activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6696	20750
Ensembl	ENSG00000118785	ENSMUSG00000029304
UniProt	P10451	P10923
RefSeq (мРНК)	NM_001251830 NM_000582 NM_001040058 NM_001040060 NM_001251829	NM_001204201 NM_001204202 NM_001204203 NM_001204233 NM_009263
RefSeq (білок)	NP_000573 NP_001035147 NP_001035149 NP_001238758 NP_001238759 NP_001035147.1	NP_001191130 NP_001191131 NP_001191132 NP_001191162 NP_033289
Локус (UCSC)	Хр. 4: 87.98 – 87.98 Mb	Хр. 5: 104.58 – 104.59 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SPP1 (англ. Secreted phosphoprotein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 314 амінокислот, а молекулярна маса — 35 423^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRIAVICFCL		LGITCAIPVK		QADSGSSEEK		QLYNKYPDAV		ATWLNPDPSQ
KQNLLAPQNA		VSSEETNDFK		QETLPSKSNE		SHDHMDDMDD		EDDDDHVDSQ
DSIDSNDSDD		VDDTDDSHQS		DESHHSDESD		ELVTDFPTDL		PATEVFTPVV
PTVDTYDGRG		DSVVYGLRSK		SKKFRRPDIQ		YPDATDEDIT		SHMESEELNG
AYKAIPVAQD		LNAPSDWDSR		GKDSYETSQL		DDQSAETHSH		KQSRLYKRKA
NDESNEHSDV		IDSQELSKVS		REFHSHEFHS		HEDMLVVDPK		SKEEDKHLKF
RISHELDSAS		SEVN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до цитокінів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з сіаловими кислотами. Секретований назовні.

Література

• Kiefer M.C., Bauer D.M., Barr P.J. (1989). The cDNA and derived amino acid sequence for human osteopontin. Nucleic Acids Res. 17: 3306—3306. PMID 2726470 DOI:10.1093/nar/17.8.3306
• Crosby A.H., Edwards S.J., Murray J.C., Dixon M.J. (1995). Genomic organization of the human osteopontin gene: exclusion of the locus from a causative role in the pathogenesis of dentinogenesis imperfecta type II. Genomics. 27: 155—160. PMID 7665163 DOI:10.1006/geno.1995.1018
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Senger D.R., Perruzzi C.A., Papadopoulos A., Tenen D.G. (1989). Purification of a human milk protein closely similar to tumor-secreted phosphoproteins and osteopontin. Biochim. Biophys. Acta. 996: 43—48. PMID 2736258 DOI:10.1016/0167-4838(89)90092-7
• Christensen B., Nielsen M.S., Haselmann K.F., Petersen T.E., Sorensen E.S. (2005). Post-translationally modified residues of native human osteopontin are located in clusters: identification of 36 phosphorylation and five O-glycosylation sites and their biological implications. Biochem. J. 390: 285—292. PMID 15869464 DOI:10.1042/BJ20050341
• Beranova-Giorgianni S., Zhao Y., Desiderio D.M., Giorgianni F. (2006). Phosphoproteomic analysis of the human pituitary. Pituitary. 9: 109—120. PMID 16807684 DOI:10.1007/s11102-006-8916-x

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11255 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017. [Архівовано 2015-09-14 у Wayback Machine.]
4. UniProt, P10451 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 4

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»