LPP

LPP
Ідентифікатори
Символи	LPP, LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma
Зовнішні ІД	OMIM: 600700 MGI: 2441849 HomoloGene: 4075 GeneCards: LPP
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, вітиліго, натуральна віспа, целіакія[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • мембрана • клітинне ядро • focal adhesion • цитоплазма • гіалоплазма • stress fiber Біологічний процес • адгезія клітин • GO:0022610 життєдіяльність • cell-cell adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4026	210126
Ensembl	ENSG00000145012	ENSMUSG00000033306
UniProt	Q93052	Q8BFW7
RefSeq (мРНК)	NM_001167671 NM_001167672 NM_005578 NM_001375455 NM_001375456 NM_001375457 NM_001375458 NM_001375459 NM_001375460 NM_001375461 NM_001375462 NM_001375463 NM_001375464 NM_001375465	NM_001145952 NM_001145954 NM_178665
RefSeq (білок)	NP_001161143 NP_001161144 NP_005569 NP_001362384 NP_001362385 NP_001362386 NP_001362387 NP_001362388 NP_001362389 NP_001362390 NP_001362391 NP_001362392 NP_001362393 NP_001362394	NP_001139424 NP_001139426 NP_848780
Локус (UCSC)	Хр. 3: 188.15 – 188.89 Mb	Хр. 16: 24.39 – 24.99 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LPP (англ. LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 612 амінокислот, а молекулярна маса — 65 746^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSHPSWLPPK		STGEPLGHVP		ARMETTHSFG		NPSISVSTQQ		PPKKFAPVVA
PKPKYNPYKQ		PGGEGDFLPP		PPPPLDDSSA		LPSISGNFPP		PPPLDEEAFK
VQGNPGGKTL		EERRSSLDAE		IDSLTSILAD		LECSSPYKPR		PPQSSTGSTA
SPPVSTPVTG		HKRMVIPNQP		PLTATKKSTL		KPQPAPQAGP		IPVAPIGTLK
PQPQPVPASY		TTASTSSRPT		FNVQVKSAQP		SPHYMAAPSS		GQIYGSGPQG
YNTQPVPVSG		QCPPPSTRGG		MDYAYIPPPG		LQPEPGYGYA		PNQGRYYEGY
YAAGPGYGGR		NDSDPTYGQQ		GHPNTWKREP		GYTPPGAGNQ		NPPGMYPVTG
PKKTYITDPV		SAPCAPPLQP		KGGHSGQLGP		SSVAPSFRPE		DELEHLTKKM
LYDMENPPAD		EYFGRCARCG		ENVVGEGTGC		TAMDQVFHVD		CFTCIICNNK
LRGQPFYAVE		KKAYCEPCYI		NTLEQCNVCS		KPIMERILRA		TGKAYHPHCF
TCVMCHRSLD		GIPFTVDAGG		LIHCIEDFHK		KFAPRCSVCK		EPIMPAPGQE
ETVRIVALDR		DFHVHCYRCE		DCGGLLSEGD		NQGCYPLDGH		ILCKTCNSAR
IRVLTAKAST		DL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клітинних контактах.

Література

• Petit M.M.R., Mols R., Schoenmakers E.F., Mandahl N., Van de Ven W.J.M. (1996). LPP, the preferred fusion partner gene of HMGIC in lipomas, is a novel member of the LIM protein gene family. Genomics. 36: 118—129. PMID 8812423 DOI:10.1006/geno.1996.0432
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Petit M.M., Swarts S., Bridge J.A., Van de Ven W.J.M. (1998). Expression of reciprocal fusion transcripts of the HMGIC and LPP genes in parosteal lipoma. Cancer Genet. Cytogenet. 106: 18—23. PMID 9772904 DOI:10.1016/S0165-4608(98)00038-7
• Rogalla P., Lemke I., Kazmierczak B., Bullerdiek J. (2000). An identical HMGIC-LPP fusion transcript is consistently expressed in pulmonary chondroid hamartomas with t(3;12)(q27-28;q14-15). Genes Chromosomes Cancer. 29: 363—366. PMID 11066083 DOI:10.1002/1098-2264(2000)9999:9999<1::AID-GCC1043>3.3.CO;2-E
• Petit M.M., Meulemans S.M., Van de Ven W.J.M. (2003). The focal adhesion and nuclear targeting capacity of the LIM-containing lipoma-preferred partner (LPP) protein. J. Biol. Chem. 278: 2157—2168. PMID 12441356 DOI:10.1074/jbc.M206106200
• Li B., Zhuang L., Reinhard M., Trueb B. (2003). The lipoma preferred partner LPP interacts with alpha-actinin. J. Cell Sci. 116: 1359—1366. PMID 12615977 DOI:10.1242/jcs.00309

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з LPP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6679 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
5. UniProt, Q93052 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 3

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»