JMJD1C (англ. Jumonji domain containing 1C ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 540 амінокислот , а молекулярна маса — 284 525[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAVETRAELV GKRFLCVAVG DEARSERWES GRGWRSWRAG VIRAVSHRDS
RNPDLAVYVE FDDLEWDKRE WVKVYEDFST FLVEYHLIWA KRNDPSQTQG
SKSKQIQWPA LTFKPLVERN IPSSVTAVEF LVDKQLDFLT EDSAFQPYQD
DIDSLNPVLR DNPQLHEEVK VWVKEQKVQE IFMQGPYSLN GYRVRVYRQD
SATQWFTGII THHDLFTRTM IVMNDQVLEP QNVDPSMVQM TFLDDVVHSL
LKGENIGITS RRRSRANQNV NAVHSHYTRA QANSPRPAMN SQAAVPKQNT
HQQQQQRSIR PNKRKGSDSS IPDEEKMKEE KYDYISRGEN PKGKNKHLMN
KRRKPEEDEK KLNMKRLRTD NVSDFSESSD SENSNKRIID NSSEQKPENE
LKNKNTSKIN GEEGKPHNNE KAGEETLKNS QPPWDQIQED KKHEEAEKRK
SVDTQLQEDM IIHSSEQSTV SDHNSNDLLP QECNMDKTHT MELLPKEKFV
SRPPTPKCVI DITNDTNLEK VAQENSSTFG LQTLQKMDPN VSDSKHSIAN
AKFLETAKKD SDQSWVSDVV KVDLTQSSVT NASSGNDHLN MEKEKYVSYI
SPLSAVSVME DKLHKRSPPP ETIKSKLNTS VDTHKIKSSP SPEVVKPKIT
HSPDSVKSKA TYVNSQATGE RRLANKIEHE LSRCSFHPIP TRSSTLETTK
SPLIIDKNEH FTVYRDPALI GSETGANHIS PFLSQHPFPL HSSSHRTCLN
PGTHHPALTP APHLLAGSSS QTPLPTINTH PLTSGPHHAV HHPHLLPTVL
PGVPTASLLG GHPRLESAHA SSLSHLALAH QQQQQLLQHQ SPHLLGQAHP
SASYNQLGLY PIIWQYPNGT HAYSGLGLPS SKWVHPENAV NAEASLRRNS
PSPWLHQPTP VTSADGIGLL SHIPVRPSSA EPHRPLKITA HSSPPLTKTL
VDHHKEELER KAFMEPLRSV ASTSAKNDLD LNRSQTGKDC HLHRHFVDPV
LNQLQRPPQE TGERLNKYKE EHRRILQESI DVAPFTTKIK GLEGERENYS
RVASSSSSPK SHIIKQDMDV ERSVSDLYKM KHSVPQSLPQ SNYFTTLSNS
VVNEPPRSYP SKEVSNIYGD KQSNALAAAA ANPQTLTSFI TSLSKPPPLI
KHQPESEGLV GKIPEHLPHQ IASHSVTTFR NDCRSPTHLT VSSTNTLRSM
PALHRAPVFH PPIHHSLERK EGSYSSLSPP TLTPVMPVNA GGKVQESQKP
PTLIPEPKDS QANFKSSSEQ SLTEMWRPNN NLSKEKTEWH VEKSSGKLQA
AMASVIVRPS SSTKTDSMPA MQLASKDRVS ERSSAGAHKT DCLKLAEAGE
TGRIILPNVN SDSVHTKSEK NFQAVSQGSV PSSVMSAVNT MCNTKTDVIT
SAADTTSVSS WGGSEVISSL SNTILASTSS ECVSSKSVSQ PVAQKQECKV
STTAPVTLAS SKTGSVVQPS SGFSGTTDFI HLKKHKAALA AAQYKSSNAS
ETEPNAIKNQ TLSASLPLDS TVICSTINKA NSVGNGQASQ TSQPNYHTKL
KKAWLTRHSE EDKNTNKMEN SGNSVSEIIK PCSVNLIAST SSDIQNSVDS
KIIVDKYVKD DKVNRRKAKR TYESGSESGD SDESESKSEQ RTKRQPKPTY
KKKQNDLQKR KGEIEEDLKP NGVLSRSAKE RSKLKLQSNS NTGIPRSVLK
DWRKVKKLKQ TGESFLQDDS CCEIGPNLQK CRECRLIRSK KGEEPAHSPV
FCRFYYFRRL SFSKNGVVRI DGFSSPDQYD DEAMSLWTHE NFEDDELDIE
TSKYILDIIG DKFCQLVTSE KTALSWVKKD AKIAWKRAVR GVREMCDACE
ATLFNIHWVC QKCGFVVCLD CYKAKERKSS RDKELYAWMK CVKGQPHDHK
HLMPTQIIPG SVLTDLLDAM HTLREKYGIK SHCHCTNKQN LQVGNFPTMN
GVSQVLQNVL NHSNKISLCM PESQQQNTPP KSEKNGGSSP ESDVGTDNKL
TPPESQSPLH WLADLAEQKA REEKKENKEL TLENQIKEER EQDNSESPNG
RTSPLVSQNN EQGSTLRDLL TTTAGKLRVG STDAGIAFAP VYSMGAPSSK
SGRTMPNILD DIIASVVENK IPPSKTSKIN VKPELKEEPE ESIISAVDEN
NKLYSDIPHS WICEKHILWL KDYKNSSNWK LFKECWKQGQ PAVVSGVHKK
MNISLWKAES ISLDFGDHQA DLLNCKDSII SNANVKEFWD GFEEVSKRQK
NKSGETVVLK LKDWPSGEDF KTMMPARYED LLKSLPLPEY CNPEGKFNLA
SHLPGFFVRP DLGPRLCSAY GVVAAKDHDI GTTNLHIEVS DVVNILVYVG
IAKGNGILSK AGILKKFEEE DLDDILRKRL KDSSEIPGAL WHIYAGKDVD
KIREFLQKIS KEQGLEVLPE HDPIRDQSWY VNKKLRQRLL EEYGVRTCTL
IQFLGDAIVL PAGALHQVQN FHSCIQVTED FVSPEHLVES FHLTQELRLL
KEEINYDDKL QVKNILYHAV KEMVRALKIH EDEVEDMEEN
Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз , регуляторів хроматину , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , іоном заліза .
Локалізований у ядрі .
Література
Wolf S.S., Patchev V.K., Obendorf M. (2007). A novel variant of the putative demethylase gene, s-JMJD1C, is a coactivator of the AR. Arch. Biochem. Biophys. 460 : 56—66. PMID 17353003 DOI :10.1016/j.abb.2007.01.017
Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res . 7 : 65—73. PMID 10718198 DOI :10.1093/dnares/7.1.65
Lee J.W., Choi H.-S., Gyuris J., Brent R., Moore D.D. (1995). Two classes of proteins dependent on either the presence or absence of thyroid hormone for interaction with the thyroid hormone receptor. Mol. Endocrinol . 9 : 243—254. PMID 7776974 DOI :10.1210/mend.9.2.7776974
Katoh M., Katoh M. (2003). Identification and characterization of TRIP8 gene in silico. Int. J. Mol. Med . 12 : 817—821. PMID 14533015
Примітки
Див. також