JMJD1C

JMJD1C
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи JMJD1C, TRIP8, TRIP-8, jumonji domain containing 1C, KDM3C
Зовнішні ІД OMIM: 604503 MGI: 1918614 HomoloGene: 3129 GeneCards: JMJD1C
Пов'язані генетичні захворювання
ювенільний ревматоїдний артрит[1]
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001242396
NM_207221
RefSeq (білок)
NP_001229325
NP_997104
Локус (UCSC) Хр. 10: 63.17 – 63.52 Mb Хр. 10: 67.1 – 67.26 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

JMJD1C (англ. Jumonji domain containing 1C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 540 амінокислот, а молекулярна маса — 284 525[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAVETRAELVGKRFLCVAVGDEARSERWESGRGWRSWRAGVIRAVSHRDS
RNPDLAVYVEFDDLEWDKREWVKVYEDFSTFLVEYHLIWAKRNDPSQTQG
SKSKQIQWPALTFKPLVERNIPSSVTAVEFLVDKQLDFLTEDSAFQPYQD
DIDSLNPVLRDNPQLHEEVKVWVKEQKVQEIFMQGPYSLNGYRVRVYRQD
SATQWFTGIITHHDLFTRTMIVMNDQVLEPQNVDPSMVQMTFLDDVVHSL
LKGENIGITSRRRSRANQNVNAVHSHYTRAQANSPRPAMNSQAAVPKQNT
HQQQQQRSIRPNKRKGSDSSIPDEEKMKEEKYDYISRGENPKGKNKHLMN
KRRKPEEDEKKLNMKRLRTDNVSDFSESSDSENSNKRIIDNSSEQKPENE
LKNKNTSKINGEEGKPHNNEKAGEETLKNSQPPWDQIQEDKKHEEAEKRK
SVDTQLQEDMIIHSSEQSTVSDHNSNDLLPQECNMDKTHTMELLPKEKFV
SRPPTPKCVIDITNDTNLEKVAQENSSTFGLQTLQKMDPNVSDSKHSIAN
AKFLETAKKDSDQSWVSDVVKVDLTQSSVTNASSGNDHLNMEKEKYVSYI
SPLSAVSVMEDKLHKRSPPPETIKSKLNTSVDTHKIKSSPSPEVVKPKIT
HSPDSVKSKATYVNSQATGERRLANKIEHELSRCSFHPIPTRSSTLETTK
SPLIIDKNEHFTVYRDPALIGSETGANHISPFLSQHPFPLHSSSHRTCLN
PGTHHPALTPAPHLLAGSSSQTPLPTINTHPLTSGPHHAVHHPHLLPTVL
PGVPTASLLGGHPRLESAHASSLSHLALAHQQQQQLLQHQSPHLLGQAHP
SASYNQLGLYPIIWQYPNGTHAYSGLGLPSSKWVHPENAVNAEASLRRNS
PSPWLHQPTPVTSADGIGLLSHIPVRPSSAEPHRPLKITAHSSPPLTKTL
VDHHKEELERKAFMEPLRSVASTSAKNDLDLNRSQTGKDCHLHRHFVDPV
LNQLQRPPQETGERLNKYKEEHRRILQESIDVAPFTTKIKGLEGERENYS
RVASSSSSPKSHIIKQDMDVERSVSDLYKMKHSVPQSLPQSNYFTTLSNS
VVNEPPRSYPSKEVSNIYGDKQSNALAAAAANPQTLTSFITSLSKPPPLI
KHQPESEGLVGKIPEHLPHQIASHSVTTFRNDCRSPTHLTVSSTNTLRSM
PALHRAPVFHPPIHHSLERKEGSYSSLSPPTLTPVMPVNAGGKVQESQKP
PTLIPEPKDSQANFKSSSEQSLTEMWRPNNNLSKEKTEWHVEKSSGKLQA
AMASVIVRPSSSTKTDSMPAMQLASKDRVSERSSAGAHKTDCLKLAEAGE
TGRIILPNVNSDSVHTKSEKNFQAVSQGSVPSSVMSAVNTMCNTKTDVIT
SAADTTSVSSWGGSEVISSLSNTILASTSSECVSSKSVSQPVAQKQECKV
STTAPVTLASSKTGSVVQPSSGFSGTTDFIHLKKHKAALAAAQYKSSNAS
ETEPNAIKNQTLSASLPLDSTVICSTINKANSVGNGQASQTSQPNYHTKL
KKAWLTRHSEEDKNTNKMENSGNSVSEIIKPCSVNLIASTSSDIQNSVDS
KIIVDKYVKDDKVNRRKAKRTYESGSESGDSDESESKSEQRTKRQPKPTY
KKKQNDLQKRKGEIEEDLKPNGVLSRSAKERSKLKLQSNSNTGIPRSVLK
DWRKVKKLKQTGESFLQDDSCCEIGPNLQKCRECRLIRSKKGEEPAHSPV
FCRFYYFRRLSFSKNGVVRIDGFSSPDQYDDEAMSLWTHENFEDDELDIE
TSKYILDIIGDKFCQLVTSEKTALSWVKKDAKIAWKRAVRGVREMCDACE
ATLFNIHWVCQKCGFVVCLDCYKAKERKSSRDKELYAWMKCVKGQPHDHK
HLMPTQIIPGSVLTDLLDAMHTLREKYGIKSHCHCTNKQNLQVGNFPTMN
GVSQVLQNVLNHSNKISLCMPESQQQNTPPKSEKNGGSSPESDVGTDNKL
TPPESQSPLHWLADLAEQKAREEKKENKELTLENQIKEEREQDNSESPNG
RTSPLVSQNNEQGSTLRDLLTTTAGKLRVGSTDAGIAFAPVYSMGAPSSK
SGRTMPNILDDIIASVVENKIPPSKTSKINVKPELKEEPEESIISAVDEN
NKLYSDIPHSWICEKHILWLKDYKNSSNWKLFKECWKQGQPAVVSGVHKK
MNISLWKAESISLDFGDHQADLLNCKDSIISNANVKEFWDGFEEVSKRQK
NKSGETVVLKLKDWPSGEDFKTMMPARYEDLLKSLPLPEYCNPEGKFNLA
SHLPGFFVRPDLGPRLCSAYGVVAAKDHDIGTTNLHIEVSDVVNILVYVG
IAKGNGILSKAGILKKFEEEDLDDILRKRLKDSSEIPGALWHIYAGKDVD
KIREFLQKISKEQGLEVLPEHDPIRDQSWYVNKKLRQRLLEEYGVRTCTL
IQFLGDAIVLPAGALHQVQNFHSCIQVTEDFVSPEHLVESFHLTQELRLL
KEEINYDDKLQVKNILYHAVKEMVRALKIHEDEVEDMEEN

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза. Локалізований у ядрі.

Література

  • Wolf S.S., Patchev V.K., Obendorf M. (2007). A novel variant of the putative demethylase gene, s-JMJD1C, is a coactivator of the AR. Arch. Biochem. Biophys. 460: 56—66. PMID 17353003 DOI:10.1016/j.abb.2007.01.017
  • Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
  • Lee J.W., Choi H.-S., Gyuris J., Brent R., Moore D.D. (1995). Two classes of proteins dependent on either the presence or absence of thyroid hormone for interaction with the thyroid hormone receptor. Mol. Endocrinol. 9: 243—254. PMID 7776974 DOI:10.1210/mend.9.2.7776974
  • Katoh M., Katoh M. (2003). Identification and characterization of TRIP8 gene in silico. Int. J. Mol. Med. 12: 817—821. PMID 14533015

Примітки

Див. також


Strategi Solo vs Squad di Free Fire: Cara Menang Mudah!