HSCB

HSCB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3BVO
Ідентифікатори
Символи	HSCB, DNAJC20, HSC20, JAC1, dJ366L4.2, HscB mitochondrial iron-sulfur cluster co-chaperone, HscB mitochondrial iron-sulfur cluster cochaperone, SIDBA5
Зовнішні ІД	OMIM: 608142 MGI: 2141135 HomoloGene: 13945 GeneCards: HSCB
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • chaperone binding • ATPase activator activity • identical protein binding • молекулярна функція Клітинна компонента • цитоплазма • мітохондрія • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • protein complex oligomerization • iron-sulfur cluster assembly • positive regulation of ATP-dependent activity • protein maturation by iron-sulfur cluster transfer • [2Fe-2S cluster assembly] Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	150274	100900
Ensembl	ENSG00000100209	ENSMUSG00000043510
UniProt	Q8IWL3	Q8K3A0
RefSeq (мРНК)	NM_172002 NM_001318314 NM_001318315 NM_001318316 NM_001363856	NM_153571 NM_001359835
RefSeq (білок)	NP_001305243 NP_001305244 NP_001305245 NP_741999 NP_001350785	NP_705799 NP_001346764
Локус (UCSC)	Хр. 22: 28.74 – 28.76 Mb	Хр. 5: 110.98 – 110.99 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HSCB (англ. HscB mitochondrial iron-sulfur cluster cochaperone) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 235 амінокислот, а молекулярна маса — 27 422^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWRGRAGALL		RVWGFWPTGV		PRRRPLSCDA		ASQAGSNYPR		CWNCGGPWGP
GREDRFFCPQ		CRALQAPDPT		RDYFSLMDCN		RSFRVDTAKL		QHRYQQLQRL
VHPDFFSQRS		QTEKDFSEKH		STLVNDAYKT		LLAPLSRGLY		LLKLHGIEIP
ERTDYEMDRQ		FLIEIMEINE		KLAEAESEAA		MKEIESIVKA		KQKEFTDNVS
SAFEQDDFEE		AKEILTKMRY		FSNIEEKIKL		KKIPL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до шаперонів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії.

Література

• Sun G., Gargus J.J., Ta D.T., Vickery L.E. (2003). Identification of a novel candidate gene in the iron-sulfur pathway implicated in ataxia-susceptibility: human gene encoding HscB, a J-type co-chaperone. J. Hum. Genet. 48: 415—419. PMID 12938016 DOI:10.1007/s10038-003-0048-9
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Uhrigshardt H., Singh A., Kovtunovych G., Ghosh M., Rouault T.A. (2010). Characterization of the human HSC20, an unusual DnaJ type III protein, involved in iron-sulfur cluster biogenesis. Hum. Mol. Genet. 19: 3816—3834. PMID 20668094 DOI:10.1093/hmg/ddq301

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28913 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.
4. UniProt, Q8IWL3 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2018. Процитовано 21 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 22

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»