GRM1

GRM1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3KS9, 4OR2
Ідентифікатори
Символи	GRM1, GPRC1A, MGLU1, MGLUR1, PPP1R85, SCAR13, glutamate metabotropic receptor 1, SCA44
Зовнішні ІД	OMIM: 604473 MGI: 1351338 HomoloGene: 649 GeneCards: GRM1
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal recessive spinocerebellar ataxia 13, spinocerebellar ataxia 44[1]
Реагує на сполуку
CPCCOEt, AIDA[2]
Онтологія гена Молекулярна функція • glutamate receptor activity • G protein-coupled receptor activity • signal transducer activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • neurotransmitter receptor activity involved in regulation of postsynaptic cytosolic calcium ion concentration • identical protein binding • G protein-coupled neurotransmitter receptor activity involved in regulation of postsynaptic cytosolic calcium ion concentration • G protein-coupled receptor activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential Клітинна компонента • integral component of membrane • G protein-coupled receptor dimeric complex • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • мембрана • G protein-coupled receptor homodimeric complex • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • дендрит (нейробіологія) • neuron projection • клітинне ядро • presynaptic membrane • Schaffer collateral - CA1 synapse • glutamatergic synapse • postsynaptic density membrane Біологічний процес • cellular response to electrical stimulus • G protein-coupled glutamate receptor signaling pathway • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration involved in phospholipase C-activating G protein-coupled signaling pathway • regulation of MAPK cascade • regulation of sensory perception of pain • locomotory behavior • sensory perception of pain • GO:0072468 сигнальна трансдукція • chemical synaptic transmission • regulation of synaptic transmission, glutamatergic • adenylate cyclase-inhibiting G protein-coupled glutamate receptor signaling pathway • regulation of postsynaptic cytosolic calcium ion concentration • G protein-coupled receptor signaling pathway • regulation of postsynaptic membrane potential Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2911	14816
Ensembl	ENSG00000152822	ENSMUSG00000019828
UniProt	Q13255	P97772
RefSeq (мРНК)	NM_000838 NM_001114329 NM_001278064 NM_001278065 NM_001278066 NM_001278067	NM_001114333 NM_016976
RefSeq (білок)	NP_001264993 NP_001264994 NP_001264995 NP_001264996	NP_001107805 NP_058672
Локус (UCSC)	Хр. 6: 146.03 – 146.44 Mb	Хр. 10: 10.56 – 10.96 Mb
PubMed search	[3]	[4]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GRM1 (англ. Glutamate metabotropic receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 194 амінокислот, а молекулярна маса — 132 357^[6].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVGLLLFFFP		AIFLEVSLLP		RSPGRKVLLA		GASSQRSVAR		MDGDVIIGAL
FSVHHQPPAE		KVPERKCGEI		REQYGIQRVE		AMFHTLDKIN		ADPVLLPNIT
LGSEIRDSCW		HSSVALEQSI		EFIRDSLISI		RDEKDGINRC		LPDGQSLPPG
RTKKPIAGVI		GPGSSSVAIQ		VQNLLQLFDI		PQIAYSATSI		DLSDKTLYKY
FLRVVPSDTL		QARAMLDIVK		RYNWTYVSAV		HTEGNYGESG		MDAFKELAAQ
EGLCIAHSDK		IYSNAGEKSF		DRLLRKLRER		LPKARVVVCF		CEGMTVRGLL
SAMRRLGVVG		EFSLIGSDGW		ADRDEVIEGY		EVEANGGITI		KLQSPEVRSF
DDYFLKLRLD		TNTRNPWFPE		FWQHRFQCRL		PGHLLENPNF		KRICTGNESL
EENYVQDSKM		GFVINAIYAM		AHGLQNMHHA		LCPGHVGLCD		AMKPIDGSKL
LDFLIKSSFI		GVSGEEVWFD		EKGDAPGRYD		IMNLQYTEAN		RYDYVHVGTW
HEGVLNIDDY		KIQMNKSGVV		RSVCSEPCLK		GQIKVIRKGE		VSCCWICTAC
KENEYVQDEF		TCKACDLGWW		PNADLTGCEP		IPVRYLEWSN		IESIIAIAFS
CLGILVTLFV		TLIFVLYRDT		PVVKSSSREL		CYIILAGIFL		GYVCPFTLIA
KPTTTSCYLQ		RLLVGLSSAM		CYSALVTKTN		RIARILAGSK		KKICTRKPRF
MSAWAQVIIA		SILISVQLTL		VVTLIIMEPP		MPILSYPSIK		EVYLICNTSN
LGVVAPLGYN		GLLIMSCTYY		AFKTRNVPAN		FNEAKYIAFT		MYTTCIIWLA
FVPIYFGSNY		KIITTCFAVS		LSVTVALGCM		FTPKMYIIIA		KPERNVRSAF
TTSDVVRMHV		GDGKLPCRSN		TFLNIFRRKK		AGAGNANSNG		KSVSWSEPGG
GQVPKGQHMW		HRLSVHVKTN		ETACNQTAVI		KPLTKSYQGS		GKSLTFSDTS
TKTLYNVEEE		EDAQPIRFSP		PGSPSMVVHR		RVPSAATTPP		LPSHLTAEET
PLFLAEPALP		KGLPPPLQQQ		QQPPPQQKSL		MDQLQGVVSN		FSTAIPDFHA
VLAGPGGPGN		GLRSLYPPPP		PPQHLQMLPL		QLSTFGEELV		SPPADDDDDS
ERFKLLQEYV		YEHEREGNTE		EDELEEEEED		LQAASKLTPD		DSPALTPPSP
FRDSVASGSS		VPSSPVSESV		LCTPPNVSYA		SVILRDYKQS		SSTL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Stephan D., Bon C., Holzwarth J.A., Galvan M., Pruss R.M. (1996). Human metabotropic glutamate receptor 1: mRNA distribution, chromosome localization and functional expression of two splice variants. Neuropharmacology. 35: 1649—1660. PMID 9076744 DOI:10.1016/S0028-3908(96)00108-6
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Desai M.A., Burnett J.P., Mayne N.G., Schoepp D.D. (1995). Cloning and expression of a human metabotropic glutamate receptor 1 alpha: enhanced coupling on co-transfection with a glutamate transporter. Mol. Pharmacol. 48: 648—657. PMID 7476890

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з GRM1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Сполуки, які фізично взаємодіють з GRM1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
3. Human PubMed Reference:.
4. Mouse PubMed Reference:.
5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4593 (англ.) . Архів оригіналу за 21 жовтня 2016. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2016-10-21 у Wayback Machine.]
6. UniProt, Q13255 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 6

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»