PROFILBARU.COM

CPEB3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2DNL, 2RUG
Ідентифікатори
Символи	CPEB3, cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3
Зовнішні ІД	OMIM: 610606 MGI: 2443075 HomoloGene: 40992 GeneCards: CPEB3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• mRNA 3'-UTR AU-rich region binding; • nucleic acid binding; • translation factor activity, RNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA stem-loop binding; • RNA binding; • translation repressor activity, mRNA regulatory element binding; • ribosome binding; • mRNA 3'-UTR binding; • translation regulator activity;
Клітинна компонента	• messenger ribonucleoprotein complex; • CCR4-NOT complex; • neuron projection; • apical dendrite; • клітинне ядро; • цитоплазма; • клітинна мембрана; • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення; • мембрана; • міжклітинні контакти; • дендрит (нейробіологія); • cell projection; • синапс; • postsynaptic membrane; • postsynapse;
Біологічний процес	• positive regulation of dendritic spine development; • negative regulation of translation; • довготривала пам'ять; • 3'-UTR-mediated mRNA destabilization; • positive regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay; • regulation of synaptic plasticity; • positive regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of cytoplasmic translation; • regulation of dendritic spine development; • positive regulation of translation; • positive regulation of mRNA polyadenylation; • negative regulation of cytoplasmic translational elongation; • cellular response to amino acid stimulus; • Біосинтез білків; • regulation of translation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	22849
	208922
	ENSG00000107864
	ENSMUSG00000039652
	Q8NE35
	Q7TN99
	NM_001178137; NM_014912
	NM_001290826; NM_001290827; NM_001290828; NM_001290829; NM_198300
	NP_001171608; NP_055727
	NP_001277755; NP_001277756; NP_001277757; NP_001277758; NP_938042
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CPEB3 (англ. Cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 10-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 698 амінокислот, а молекулярна маса — 76 014^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQDDLLMDKS	KTQPQPQQQQ	RQQQQPQPES	SVSEAPSTPL	SSETPKPEEN
SAVPALSPAA	APPAPNGPDK	MQMESPLLPG	LSFHQPPQQP	PPPQEPAAPG
ASLSPSFGST	WSTGTTNAVE	DSFFQGITPV	NGTMLFQNFP	HHVNPVFGGT
FSPQIGLAQT	QHHQQPPPPA	PAPQPAQPAQ	PPQAQPPQQR	RSPASPSQAP
YAQRSAAAAY	GHQPIMTSKP	SSSSAVAAAA	AAAAASSASS	SWNTHQSVNA
AWSAPSNPWG	GLQAGRDPRR	AVGVGVGVGV	GVPSPLNPIS	PLKKPFSSNV
IAPPKFPRAA	PLTSKSWMED	NAFRTDNGNN	LLPFQDRSRP	YDTFNLHSLE
NSLMDMIRTD	HEPLKGKHYP	PSGPPMSFAD	IMWRNHFAGR	MGINFHHPGT
DNIMALNNAF	LDDSHGDQAL	SSGLSSPTRC	QNGERVERYS	RKVFVGGLPP
DIDEDEITAS	FRRFGPLVVD	WPHKAESKSY	FPPKGYAFLL	FQEESSVQAL
IDACLEEDGK	LYLCVSSPTI	KDKPVQIRPW	NLSDSDFVMD	GSQPLDPRKT
IFVGGVPRPL	RAVELAMIMD	RLYGGVCYAG	IDTDPELKYP	KGAGRVAFSN
QQSYIAAISA	RFVQLQHNDI	DKRVEVKPYV	LDDQMCDECQ	GTRCGGKFAP
FFCANVTCLQ	YYCEYCWASI	HSRAGREFHK	PLVKEGGDRP	RHVPFRWS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, альтернативний сплайсинг, метилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Salehi-Ashtiani K., Luptak A., Litovchick A., Szostak J.W. (2006). A genomewide search for ribozymes reveals an HDV-like sequence in the human CPEB3 gene. Science. 313: 1788—1792. PMID 16990549 DOI:10.1126/science.1129308
Peng S.C., Lai Y.T., Huang H.Y., Huang H.D., Huang Y.S. (2010). A novel role of CPEB3 in regulating EGFR gene transcription via association with Stat5b in neurons. Nucleic Acids Res. 38: 7446—7457. PMID 20639532 DOI:10.1093/nar/gkq634
Chen Y.C., Sargsyan K., Wright J.D., Huang Y.S., Lim C. (2014). Identifying RNA-binding residues based on evolutionary conserved structural and energetic features. Nucleic Acids Res. 42: E15—E15. PMID 24343026 DOI:10.1093/nar/gkt1299
Giangarra V., Igea A., Castellazzi C.L., Bava F.A., Mendez R. (2015). Global analysis of CPEBs reveals sequential and non-redundant functions in mitotic cell cycle. PLoS ONE. 10: E0138794—E0138794. PMID 26398195 DOI:10.1371/journal.pone.0138794

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21746 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8NE35 (англ.) . Архів оригіналу за 2 серпня 2016. Процитовано 19 вересня 2017.