У кваліфікації взяло участь 53 національні збірні з футболу. Однак, через присутність господарів двох цих змагань, в кожному із відбіркових турнірів взяло участь 52 команди. Збірна ПАР автоматично кваліфікувалась як команда-господар Чемпіонату світу, [1]збірна Анголи — як команда-господар Кубка африканських націй.
Збірні Сан Томе і Принсипі та ЦАР знялись зі змагань. У результаті збірні Свазіленду та Сейшельських островів (команди із найвищим рейтингом серед десяти учасників першого раунду) брали участь із другого раунду кваліфікації, а збірні Джибуті та Сомалі зіграли матчі цього раунду між собою.[3]
Переможця в протистоянні між збірними Джибуті та Сомалі визначали за результатами одного матчу, оскільки Сомалі не відповідало критеріям проведення матчів під егідою ФІФА.
Збірна Анголи автоматично кваліфікувалась як команда-господар Кубка африканських націй 2010. Однак, для неї діяли ті самі умови для проходження в наступний раунд кваліфікації до Чемпіонату світу що і для інших команд.
Збірна ПАР автоматично кваліфікувалась як команда-господар Чемпіонату світу. Однак для неї діяли ті самі умови для проходження в наступний раунд кваліфікації до Кубка націй що і для інших команд.
Збірна Чаду була дискваліфікована з кваліфікації до Кубка африканських націй 2010. В залік брались до уваги тільки матчі між збірними Малі, Судану та Конго. Не зважаючи на це Чад мав право брати участь у кваліфікаційномі турнірі до Чемпіонату світу 2010.[6]
Для кваліфікаційного турніру Кубка африканських націй:
До наступного раунду кваліфікувались 12 команд, що посіли перші місця в групах, та 8 команд, що посіли другі місця із найбільшою кількістю очок. Оскільки не всі групи мали однакову кількість команд через відмову збірної Еритреї і дискваліфікацію збірної Ефіопії, для підрахунку очок в групах із чотирма учасниками не враховувались очки, набрані в матчах з командою, що зайняла четверте місце.[8]
Переможці груп візьмуть участь у фінальній частині Чемпіонату світу 2010 року. Команди, що зайняли перші три місця в кожній групі візьмуть участь у розіграші Кубка африканських націй 2010.
Жеребкування
Команди були поділені водповідно до рейтингу ФІФА станом на жовтень 2008 (в дужках вказано місце в рейтингу).[10] Групи складались із однієї команди з кожного кошика.[11]
Алжир та Єгипет закінчили груповий турнір з однаковими показниками, тому був проведений додатковий поєдинок за результатами якого Алжир кваліфікувався в фінальну частину Чемпіонату світу.