Тимопоетин

TMPO
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1GJJ, 1H9F, 1H9E
Ідентифікатори
Символи	TMPO, CMD1T, LAP2, LEMD4, PRO0868, TP, thymopoietin
Зовнішні ІД	OMIM: 188380 MGI: 106920 HomoloGene: 31144 GeneCards: TMPO
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • lamin binding • cadherin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • Хроматин • nuclear envelope • клітинне ядро • хромосома • цитоплазма • integral component of membrane • nuclear inner membrane • ядерна мембрана • мембрана Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7112	21917
Ensembl	ENSG00000120802	ENSMUSG00000019961
UniProt	P42166 P42167	Q61029 Q61033
RefSeq (мРНК)	NM_001032283 NM_001032284 NM_001307975 NM_003276	NM_001080129 NM_001080130 NM_001080131 NM_001080132 NM_001080134 NM_011605 NM_001283048
RefSeq (білок)	NP_001027454 NP_001027455 NP_001294904 NP_003267 NP_001027454.1 NP_001027455.1 NP_001294904.1 NP_001027454.1	NP_001073598 NP_001073599 NP_001073600 NP_001073601 NP_001269977 NP_035735 NP_035735.2
Локус (UCSC)	Хр. 12: 98.52 – 98.55 Mb	Хр. 10: 90.98 – 91.02 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TMPO (англ. Thymopoietin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 694 амінокислот, а молекулярна маса — 75 492^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPEFLEDPSV		LTKDKLKSEL		VANNVTLPAG		EQRKDVYVQL		YLQHLTARNR
PPLPAGTNSK		GPPDFSSDEE		REPTPVLGSG		AAAAGRSRAA		VGRKATKKTD
KPRQEDKDDL		DVTELTNEDL		LDQLVKYGVN		PGPIVGTTRK		LYEKKLLKLR
EQGTESRSST		PLPTISSSAE		NTRQNGSNDS		DRYSDNEEGK		KKEHKKVKST
RDIVPFSELG		TTPSGGGFFQ		GISFPEISTR		PPLGSTELQA		AKKVHTSKGD
LPREPLVATN		LPGRGQLQKL		ASERNLFISC		KSSHDRCLEK		SSSSSSQPEH
SAMLVSTAAS		PSLIKETTTG		YYKDIVENIC		GREKSGIQPL		CPERSHISDQ
SPLSSKRKAL		EESESSQLIS		PPLAQAIRDY		VNSLLVQGGV		GSLPGTSNSM
PPLDVENIQK		RIDQSKFQET		EFLSPPRKVP		RLSEKSVEER		DSGSFVAFQN
IPGSELMSSF		AKTVVSHSLT		TLGLEVAKQS		QHDKIDASEL		SFPFHESILK
VIEEEWQQVD		RQLPSLACKY		PVSSREATQI		LSVPKVDDEI		LGFISEATPL
GGIQAASTES		CNQQLDLALC		RAYEAAASAL		QIATHTAFVA		KAMQADISQA
AQILSSDPSR		THQALGILSK		TYDAASYICE		AAFDEVKMAA		HTMGNATVGR
RYLWLKDCKI		NLASKNKLAS		TPFKGGTLFG		GEVCKVIKKR		GNKH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Harris C.A., Andryuk P.J., Cline S.W., Siekierka J.J., Goldstein G. (1995). Structure and mapping of the human thymopoietin (TMPO) gene and relationship of human TMPO beta to rat lamin-associated polypeptide 2. Genomics. 28: 198—205. PMID 8530026 doi:10.1006/geno.1995.1131
• Audhya T., Schlesinger D.H., Goldstein G. (1987). Isolation and complete amino acid sequence of human thymopoietin and splenin. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 3545—3549. PMID 3473468 doi:10.1073/pnas.84.11.3545
• Goldstein G., Schlesinger D.H., Audhya T. (1994). Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 6249—6249. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка) PMID 8016147 doi:10.1073/pnas.91.13.6249
• Markiewicz E., Dechat T., Foisner R., Quinlan R.A., Hutchison C.J. (2002). Lamin A/C binding protein LAP2alpha is required for nuclear anchorage of retinoblastoma protein. Mol. Biol. Cell. 13: 4401—4413. PMID 12475961 doi:10.1091/mbc.E02-07-0450
• Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line. Electrophoresis. 28: 2027—2034. PMID 17487921 doi:10.1002/elps.200600782
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 doi:10.1021/pr800500r

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11875 (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2017-06-18 у Wayback Machine.]
4. UniProt, P42166 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 12

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»