Гістон H1c

Гістон H1c
Ідентифікатори
Символи	H1-2, H1.2, H1C, H1F2, H1s-1, histone cluster 1, H1c, histone cluster 1 H1 family member c, HIST1H1C, H1.2 linker histone, cluster member
Зовнішні ІД	OMIM: 142710 MGI: 1931526 HomoloGene: 68455 GeneCards: H1-2
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • chromatin DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • double-stranded DNA binding • nucleosomal DNA binding Клітинна компонента • Нуклеосома • клітинне ядро • хромосома Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • histone H3-K4 trimethylation • nucleosome assembly • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • histone H3-K27 trimethylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • chromosome condensation • negative regulation of DNA recombination Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3006	50708
Ensembl	ENSG00000187837	ENSMUSG00000036181
UniProt	P16403	P15864
RefSeq (мРНК)	NM_005319	NM_015786
RefSeq (білок)	NP_005310	NP_056601
Локус (UCSC)	Хр. 6: 26.06 – 26.06 Mb	Хр. 13: 23.92 – 23.92 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Гістон H1c (англ. Histone cluster 1 H1 family member c) – білок, який кодується геном HIST1H1C, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 213 амінокислот, а молекулярна маса — 21 365^[4].

Представник родини білків гістонів H1.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSETAPAAPA		AAPPAEKAPV		KKKAAKKAGG		TPRKASGPPV		SELITKAVAA
SKERSGVSLA		ALKKALAAAG		YDVEKNNSRI		KLGLKSLVSK		GTLVQTKGTG
ASGSFKLNKK		AASGEAKPKV		KKAGGTKPKK		PVGAAKKPKK		AAGGATPKKS
AKKTPKKAKK		PAAATVTKKV		AKSPKKAKVA		KPKKAAKSAA		KAVKPKAAKP
KVVKPKKAAP		KKK

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Marzluff W.F., Gongidi P., Woods K.R., Jin J., Maltais L.J. (2002). The human and mouse replication-dependent histone genes. Genomics. 80: 487—498. PMID 12408966 DOI:10.1006/geno.2002.6850
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Parseghian M.H., Henschen A.H., Krieglstein K.G., Hamkalo B.A. (1994). A proposal for a coherent mammalian histone H1 nomenclature correlated with amino acid sequences. Protein Sci. 3: 575—587. PMID 8003976 DOI:10.1002/pro.5560030406
• Parseghian M.H., Newcomb R.L., Winokur S.T., Hamkalo B.A. (2000). The distribution of somatic H1 subtypes is non-random on active vs. inactive chromatin: distribution in human fetal fibroblasts. Chromosome Res. 8: 405—424. PMID 10997781 DOI:10.1023/A:1009262819961
• Th'ng J.P., Sung R., Ye M., Hendzel M.J. (2005). H1 family histones in the nucleus. Control of binding and localization by the C-terminal domain. J. Biol. Chem. 280: 27809—27814. PMID 15911621 DOI:10.1074/jbc.M501627200
• Eick S., Nicolai M., Mumberg D., Doenecke D. (1989). Human H1 histones: conserved and varied sequence elements in two H1 subtype genes. Eur. J. Cell Biol. 49: 110—115. PMID 2759094

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4716 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 30 січня 2017.
4. UniProt, P16403 (англ.) . Архів оригіналу за 6 липня 2017. Процитовано 30 січня 2017.

Див. також

• Хромосома 6

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»