Japonya'nın köyleri (村 mura), Japonya'nın yerel idari bölümlerinden biridir. Coğrafi olarak köyler prefektörlüklere bağlıdırlar. İdari olarak en alt düzeydeki belediyelerdir.
Köylerin sayısı belediye birleştirmelerinin sonucu azalmaktadır. Günümüzde Tochigi, Fukui, Ishikawa, Shizuoka, Hyōgo, Mie, Shiga, Hiroşima, Yamaguchi, Ehime, Kagawa, Nagasaki ve Saga olmak üzere 13 prefektörlükte köy bulunmamaktadır.
1 Nisan 2015 tarihi itibarıyla Japonya'da 183 köy bulunmaktadır.[1]