Fenerbahçe Boks Şubesi 1998-99 sezonuna İstanbul Ferdi Boks Şampiyonası'nda şampiyon olarak başladı. Türkiye Ferdi Boks Şampiyonası'nda şampiyon olan sarı-lacivertliler Türkiye Kulüplerarası Boks Şampiyonası'nda aynı başarıya ulaşarak müteakip sezon Avrupa Şampiyon Kulüpler Kupasında mücadele etme hakkı kazandı.
İstanbul Ferdi Boks Şampiyonası 27-28 Haziran 1998 tarihlerinde düzenlendi ve Beşiktaş'ın dört birinciliğine karşı altı birincilik kazanarak 10'u Kulüplerarası Şampiyona'da kazanılmak üzere toplamda 26. kez İstanbul şampiyonu oldu.
Şampiyona, 9-12 Ekim 1998 tarihlerinde İnegöl'de düzenlendi. Şampiyonada büyük varlık gösteren Fenerbahçe 4 altın ve 2 gümüş madalya kazanarak takım halinde şampiyon oldu.
Fenerbahçe, 3-5 Aralık 1998 tarihlerinde Kayseri'de düzenlenen Türkiye Kulüplerarası Boks Şampiyonası'ndan önce şampiyon kadrosuna Agasi Ağagüloğlu, Ramazan Palyani, Serdar Yağlı ve Selim Palyani ve Akın Kuloğlu'nu katarak adeta rakipsiz hale geldi.[1] Şampiyonada 7 altın, 1 gümüş ve 1 bronz madalyayla 41 puan toplayan sarı-lacivertliler, 26 puanlı Beşiktaş'ın önünde Türkiye şampiyonu oldu.[2]