โบสถ์นักบุญนิโคลัส (เอสโตเนีย: Niguliste kirik, เยอรมัน: Nikolaikirche[1]) เป็นโบสถ์ยุคกลางในทาลลินน์ ประเทศเอสโตเนีย อุทิศแด่นักบุญนิโคลัส โบสถ์สร้างขึ้นครั้งแรกในศตวรรษที่ 13 และถูกทำลายไปบางส่วนเมื่อครั้นโซเวียตทิ้งระเบิดในทาลลินน์สมัยสงครามโลกครั้งที่สอง อาคารได้รับการทำนุบำรุงขึ้นมาใหม่ แต่ไม่มีการจัดพิธีในโบสถ์นับจากนั้น ปัจจุบันโบสถ์เป็นพิพิธภัณฑ์ในชื่อ Niguliste Museum เป็นสาขาของพิพิธภัณฑ์ศิลปะแห่งเอสโตเนีย จัดแสดงงานศิลปะจากศตวรรษที่ 13 เรื่อยมา นอกจากนี้อาคารยังถูกใช้เป็นพื้นที่จัดคอนเสิร์ตแ้วยเช่นกัน[2]