สัตว์ป่าในประเทศนอร์ทมาซิโดเนีย มีอยู่มากมาย เช่น หมี หมูป่า หมาป่า สุนัขจิ้งจอก กระรอก เลียงผา และกวางลิงซ์ยูเรเชีย พบได้น้อยมากในเทือกเขาทางตะวันตกของมาซิโดเนีย จำนวนสัตว์ทั้งหมดที่รายงานจนถึงปัจจุบันมีจำนวนทั้งสิ้น 10,354 ตัว
ในทะเลสาบสามแห่งทางเขตฟูนา เป็นที่อยู่ของสัตว์น้ำและสัตว์บกประกอบไปด้วยปลาเทราท์เลตเทอร์ ปลาเทราท์เลค ปลาทู ปลากะรัง นกพิราบ[1]