สมาพันธ์เบสบอลมัธยมปลายญี่ปุ่น (ญี่ปุ่น: 財団法人日本高等学校野球連盟) เป็นสมาพันธ์ที่อำนาจในการบริหารการแข่งขันเบสบอลมัธยมปลายของญี่ปุ่นโดยตรง ร่วมกับสมาพันธ์เบสบอลมัธยมปลายอีก 47 จังหวัดทั่วประเทศญี่ปุ่น มีชื่อเล่นว่า "โคยะเร็น" (高野連)
สมาพันธ์เบสบอลมัธยมปลายญี่ปุ่นดำเนินกิจกรรมกีฬาเบสบอลเป็นเอกเทศจากสมาพันธ์กีฬามัธยมปลายญี่ปุ่น จึงทำให้การแข่งขันเบสบอลชิงแชมป์มัธยมปลายญี่ปุ่น หรือโคชิเอ็งฤดูร้อน ไม่ถือเป็นส่วนหนึ่งของการแข่งขันอินเตอร์ไฮแต่อย่างใด
โคยะเร็นวิวัฒนาการมาจากสมาพันธ์เบสบอลกีฬามัธยมขั้นสองญี่ปุ่น โดยก่อตั้งขึ้นมาในปี 1946 เพื่อเป็นโต้โผใหญ่ในการแข่งขันเบสบอลชิงแชมป์มัธยมขั้นสองญี่ปุ่น[1] ซึ่งเดิมดำเนินรายการโดยอาซาฮีชิมบุง สื่อชื่อดังจากจังหวัดโอซากะในช่วงก่อนสงครามโลก
หลังสงครามโลกครั้งที่สองสิ้นสุดลง โรงเรียนมัธยมขั้นสองได้กลายเป็น "มัธยมปลาย" ทำให้ชื่อต้องถูกเปลี่ยนเป็น "สมาพันธ์เบสบอลมัธยมปลายญี่ปุ่น" ต่อมาในปี 1963 สมาพันธ์จึงแยกตัวเป็นองค์กรที่เป็นเอกเทศกับสมาพันธ์กีฬามัธยมปลายญี่ปุ่น และกระทรวงศึกษาธิการ วัฒนธรรม กีฬา วิทยาศาสตร์ และเทคโนโลยี