Kungliga Karlskrona Amiralitetsförsamling är en församling i Blekinge kontrakt, Lunds stift. Församlingen är en amiralitetsförsamling och en av de fem icke-territoriella församlingarna inom Svenska kyrkan och bildar ett eget pastorat.
För att få tillhöra församlingen måste man vara bosatt i Karlskrona kommun eller Ronneby kommun och dessutom uppfylla något av följande krav (från Svenska kyrkans kyrkoordning):
Församlingen bildades 1681 och utgör sedan dess ett eget pastorat.[2]
Församlingen har en kyrka, Amiralitetskyrkan som ligger i centrala Karlskrona. Utanför kyrktrappan står den berömda fattigbössan Gubben Rosenbom.
Mellan åren 1690-1846 var amiralitetssuperintendenten (kyrkoherden) även kyrkoherde i stadsförsamlingen. Från och med 1846 benämns kyrkoherden i amiralitetsförsamlingen för amiralitetspastor.
I kyrkovalet 2013 fick den lokala nomineringsgruppen Karlskrona Amiralitetsförsamlings värnare och utvecklare 85,53 % av rösterna och 13 mandat i kyrkofullmäktige. Arbetarepartiet-Socialdemokraterna fick 14,47 % av rösterna och de resterande två platserna i fullmäktige.[5]