Johan Lindegren (enligt dopboken namngiven Johannes efter sin farfar) var son till bonden Andreas Johansson från Kullen i Ullared och hans hustru Inger Lena Carlsdotter. Hans musikaliska begåvning uppenbarades i unga år. Sina första orgellektioner fick han av pastoratets komminister B. A. Törnblom. Trots att fadern motsatte sig det, drev Törnblom igenom att ynglingen skulle få studera för organisten Holmdahl i Skällinge. År 1860 fortsatte studierna vid Musikkonservatoriet, i piano, violin och teori. Han anställdes 1865 vid Kungliga teatern som korist, och blev repetitör där 1874. Två år senare blev han lärare i kontrapunktik vid konservatoriet. År 1881 blev han sånglärare vid Jakobs läroverk och 1885 kantor i Storkyrkan i Stockholm.
Några av Lindegrens tonsättningar förekommer i de svenska psalmböckerna 1921 och troligen 1937, men finns inte medtagna i Den svenska psalmboken 1986. Han har även komponerat pianostycken, en stråkkvintett i F-dur, en sonat i h-moll, en fuga, samt en elegie in memoriam till operasångaren Oscar Arnoldson. Hans kompositioner utmärks av polyfona strukturer, samt en strävan efter en mer äkta rytmik och en gränsöverskridande harmonik.
Lindegren gifte sig 1880 med Josefina Grönberg.
Verklista
Kammarmusik
Kvintett i F-dur för 2 violiner, 2 violor, 1 violoncell (tryckt 1909)
Pianoverk
Fuga uti fri stil (tryckt 1866.)
Stor sonat (”canon”) op. 2, (tryckt 1867.)
Miniatyrbilder (Necken, Svensk Musiktidning nr 3, vol. 1, 1880)
1. Ballad
2. Vid en blommas graf.
Till allra kärestan. Salongsstycke. Necken. Svensk Musiktidning, vol. 1, nr 4, 1880)
Polarfararnes vals (Necken. Svensk Musiktidning, vol. 1, nr 6, 1880)
Serenad (Necken. Svensk Musiktidning, vol. 1, nr 7, 1880.)
Små lätta pianostycken. (Necken. Svensk Musiktidning, vol. 1, nr 7, 1880)
II. Sorg i rosenrödt
III. Mazurka.
Meditationer I och II. (Necken. Svensk Musiktidning, vol. 1, nr 23, 1880.)
Fest-Marsch komponerad för orkester. Arrangement för piano och fyra händer. Till Vegas hjeltar (orkesterversionen förkommen eller aldrig utförd, 1880)
Elegi vid Oscar Arnoldsons frånfälle (1881.)
Fantasie-Polonaise (tryckt 1892.)
Kanon-Rhapsodie (tryckt 1898)
Orgelverk
Melodi för orgel eller piano. (Tidning för kyrkomusik, vol. 1, nr 1, 1881.)
Fuga över Agnus Dei. (Urania, musik för kyrkan skolan och hemmet, 1882,bilaga till Tidning för kyrkomusik)
Melodi för orgel eller piano. (Tidning för kyrkomusik, vol. 1, nr 7, 1881)
Melodi för orgel eller piano. (Tidning för kyrkomusik, vol. 2, nr 1, 1882.)
Lätta choralförspel. (Urania, musik för kyrkan skolan och hemmet, 1882)
Sånger
Som i ungdomens år, för röst och piano (1876)
Liljan i dalen, för röst och piano (Necken. Svensk Musiktidning nr 23, vol. 1, 1880.)
