När grannhuset 1865–67 byggdes om till att fungera som riksdagshus förenades Hebbeska huset ut- och invändigt med detta. Samtidigt drogs järnvägen över Riddarholmen och skilde Hebbeska huset från Riddarholmskanalen. Idag är det bara västra vingen som står kvar. På kartor från 1700-talet ser man att dagens hus var jämförbart med flera större palats. Idag är Hebbeska huset statligt byggnadsminne och förvaltas av Statens fastighetsverk.