Direkt efter att han la av med sin aktiva spelarkarriär så fick han jobb som tränare för ECHL-laget Huntington Blizzard, där blev det dock bara en säsong innan New York Rangers hörde av sig och erbjöd honom att bli assisterande tränare för organisationen. Han sa ja till dem och var där fram till 2000 när Oilers blev nästa anhalt i sin tränarkarriär, hos Oilers så hade han samma roll som hos Rangers. Under sommaren 2009 gjorde Oilers förändringar i sin tränarstab och Huddy fick gå. Den 4 augusti samma år meddelade Dallas Stars offentligt att man hade anställt Huddy som ny assisterande tränare till sin tränarstab som leddes av den dåvarande tränaren Marc Crawford.[2] Den 15 juli 2011 blev Huddy anställd av Winnipeg Jets som återigen assisterande tränare.[3][4][5]
