Префектуре Јапана представљају највишу јединицу административне подјеле Јапана: једна префектура главног града (都,to), Токио; један енгл."circuit"/territory (道,dō), Хокаидо; двије урбане префектуре (府,fu), Осака и Кјото; и осталих 43 префектура (県,ken). Префектуре представљају виши ниво државне управе од градова, мањих градова и села. Бивше покрајине Јапана су замјењене префектурама 1870. године.
Префектуре су државне јединице веће од градова, насеља и села и еквивалентне су окрузима у многим другим државама.
За сваку префектуру се бира једнодомна скупштина на четверогодишни мандат која је одговорна за буџет и уредбе. Скупштина бира гувернере префектура.
Свака префектура се дјели на велеградове и округе, а сваки округ се дјели на градске и сеоске општине. Има, додуше и изузетака: на примјер Хокаидо је подјељен на 14 подпрефектура које представљају филијале префектуре. Неке друге префектуре такође имају огранке које спроводе управне функције ван префектуре. Токио је обједињен као град-префектура који има карактеристике и града и префектуре.
Списак префектура
Списак префектура по ISO
Префектуре су груписане у девет региона у Јапану. Означене су од севера према југу и нумерисане на основу стандарда ISO 3166-2:JP, Међународне организације за стандардизацију и то:
