Maleilacetoacetatna izomeraza (EC 5.2.1.2, maleilacetoacetinska izomeraza, maleilacetonska izomeraza, maleilaceton cis-trans-izomeraza) je enzim sa sistematskim imenom 4-maleilacetoacetat cis-trans-izomeraza.[1][2][3] Ovaj enzim katalizuje sledeću hemijsku reakciju
Ovaj enzim takođe deluje na maleilpiruvat.