PROFILBARU.COM

Dostupne proteinske strukture:
Pfam	structures
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Kolagenski trostruki heliks
Kolagenski trostruki heliks
	Model kolagenskog heliksa.
Identifikatori
Simbol	Kolagen
Pfam	PF01391
InterPro	IPR008160
SCOP	1a9a
SUPERFAMILY	1a9a
Pfam
Dostupne proteinske strukture:
Pfam	structures
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Kolagen, kolagenski heliks, ili heliks tipa-2, je glavni oblik sekundarne strukture. On se sastoji od trostrukog heliksa formiranog od ponavljanja aminokiselinske sekvence glicin - X - Y, gde su X i Y često prolin ili hidroksiprolin.^[2]

Svaki od tri lanca je stabilizovan sternom repulzijom proizvedenom pirolidinskim prstenima prolina i hidroksiprolina. Pirolidinski prsteni se odbijaju kad polipeptidni lanac zauzme izduženu heliksnu formu, koja je znatno otvorenija od gušće pakovane forme alfa heliksa.

Tri lanca su međusobno vezana vodoničnim vezama. Donori vodonikčnih veza su peptidne NH grupe glicinskih ostataka. Akceptori vodoničnih veza su CO grupe ostataka drugih lanaca. Hidroksilna grupa hidroksiprolina takođe učestvuje u vodoničnom vezivanju. Hod kolagenskog heliksa je 2,9 Å (0.29 nm) po ostatku.

Reference

^ Berisio R, Vitagliano L, Mazzarella L, Zagari A (2002). „Crystal structure of the collagen triple helix model [(Pro-Pro-Gly)(10)](3)”. Protein Sci. 11 (2): 262—70. PMC 2373432 . PMID 11790836. doi:10.1110/ps.32602.
^ Bhattacharjee A, Bansal M (2005). „Collagen structure: the Madras triple helix and the current scenario”. IUBMB Life. 57 (3): 161—72. PMID 16036578. doi:10.1080/15216540500090710.