Mark Webber je debitiral v sezoni 2002 na domači dirki za Veliko nagrado Avstralije, ko je z nekonkurenčnim Minardijem dosegel peto mesto. Kljub temu, da mu je nekoliko pomagalo tudi dejstvo, da je dirko končalo le osem dirkačev, je bil to nepričakovan uspeh, saj so bile to prve točke za Minardi po šestem mestu Marca Genéja na Veliki nagradi Evrope v sezoni 1999. Čeprav so bile to Webbrove edine točke v sezoni je bilo dovolj, da je prepričal vodilne pri Jaguarju, kjer je dirkah v sezonah 2003 in 2004. Dosegel je kar nekaj uvrstitev v točke, toda uspeha na prvi dirki kariere mu ni uspelo izenačiti ali izboljšati, v sezoni 2005 pa mu je z Williamsom uspel največji uspeh kariere do takrat, tretje mesto na prestižni dirki za Veliko nagrado Monaka. Toda v sezoni 2006 je z Williamsom po seriji okvar in trčenj dosegel le trikrat točke, za dve šesti in eno osmo mesto. V sezoni 2007 je dirkal za Red Bull ob veteranu Davidu Coulthardu, ki pa je bil presenetljivo uspešnejši od Webbra, ki je dosegel tri uvrstitve med dobitnike točk, ob dveh sedmih mestih tudi tretje mesto na dirki za Veliko nagrado Evrope. Skupno je zasedel dvanajsto mesto v dirkaškem prvenstvu z desetimi točkami.
V sezoni 2009 je bil do zaključka sezone v boju za naslov prvaka, ob zmagah na dirkah za Veliko nagrado Nemčije in Veliko nagrado Brazilije, prvih v karieri sploh, je dosegel še šest uvrstitev na stopničke, toda pet zaporednih dirk brez osvojene točke v drugi polovici sezone ga je izločilo iz boja za naslov. Na koncu je osvojil četrto mesto v prvenstvu. V sezoni 2010 je po slabšem začetku v srednjem delu sezone dosegel štiri zmage in dolgo vodil v prvenstvu, toda zaradi slabšega zaključka sezone z odstopom po napaki na dirki za Veliko nagrado Koreje je naslov izgubil na zadnji dirki sezone za Veliko nagrado Abu Dabija z le osmim mestom. Pred dirko je bil drugi v prvenstvu, ob koncu pa je padel na tretje mesto. V sezoni 2011 ni dosegel takšnih uspehov, saj je edino zmago osvojil šele na zadnji dirki sezone za Veliko nagrado Brazilije, s katero si je ob še devetih uvrstitvah na stopničke zagotovil tretje mesto v dirkaškem prvenstvu. V sezoni 2012 je dosegel dve zmagi, vseeno pa je bil le šesti v prvenstvu zaradi ne dovolj konstantnih rezultatov, kajti ob tem je osvojil le še dve uvrstitvi na stopničke. Boljši je bil v sezoni 2013, kljub temu, da mu ni uspelo zmagati, je s sedmimi uvrstitvami na stopničke še tretjič v karieri osvojil tretje mesto v prvenstvu. Že sredi sezone je napovedal zaključek svoje kariere v Formuli 1 ob koncu sezone 2013.