Mužská dvojhra na Open 13 2006 sa hrala ako súčasť Open 13 2006 od 13. do 20. februára 2006. Titul získal Francúz Arnaud Clément, ktorý vo finále porazil Chorváta Ančića 6-4 6-2. Bol to jeho tretí titul v dvojhre na okruhu ATP.