Agneša Habsburská alebo Agnesa Habsburská (* 18. máj 1281 – † 11. jún 1364, kláštor Königsfelden, Švajčiarsko) bola uhorská a chorvátska kráľovná, manželka posledného Arpádovca Ondreja III.
Agneša, druhá dcéra rakúskeho vojvodu Albrechta a Alžbety Tirolskej, bola v rámci habsburskej sobášnej politiky vydatá za uhorského kráľa Ondreja. Svadba sa konala 13. februára 1296 vo Viedni. Manželstvo bolo krátke, Ondrej v januári 1301 náhle zomrel. Na uhorský trón mal zasadnúť snúbenec jedinej Ondrejovej dcéry Alžbety, Václav III.
Mladá vdova Agneša nemala žiadnu faktickú politickú moc, preto po manželovej smrti z Uhorska odišla naspäť do Rakúska a po roku 1308 spoločne s bratmi a matkou založila kláštor Königsfelden.
Tento článok je čiastočný alebo úplný preklad článku Anežka Habsburská (1280-1364) na českej Wikipédii.