Сан-Мигел-дас-Мисойнс (порт.São Miguel das Missões) — муниципалитет в Бразилии, входит в штат Риу-Гранди-ду-Сул. Составная часть мезорегиона Северо-запад штата Риу-Гранди-ду-Сул. Входит в экономико-статистический микрорегион Санту-Анжелу. Население составляет 7514 человека на 2006 год. Занимает площадь 1 229,844 км². Плотность населения — 6,1 чел./км².
В муниципалитете расположены развалины миссии Сан-Мигел-дас-Мисойнс, включённой в список всемирного наследия ЮНЕСКО.