Шейх Мухаммад ибн Халифа Аль Халифа (араб. محمد بن خليفة بن سلمان آل خليفة; умер в 1890 г.) — шестой хаким Бахрейна (1843—1868) из династии Аль Халифа. В его правление Бахрейн стал частью Договорного Омана.
Третий сын шейха Халифы ибн Салмана Аль Халифы, хакима Бахрейна (1821—1834), внук шейха Салмана ибн Ахмада Аль Халифы, хакима Бахрейна (1795—1821), и правнук шейха Ахмада ибн Мухаммада Аль Халифы, хакима Бахрейна (1783—1795). У Мухаммада было четверо братьев: Али, Дуайдж, Салман и Рашид.
Мухаммад занимал пост губернатора Манамы во время правления своего отца Халифы ибн Салмана[1]. Мухаммад сменил своего отца на посту хакима Бахрейна, когда он скончался в 1834 году. Отец и дед Мухаммада были соправителями Абдаллы ибн Ахмада аль Халифы, правившего в 1795—1843 годах. В 1842 году Мухаммда выступил против своего двоюродного деда Абдаллы ибн Ахмада и объявил себя правителем Бахрейна и Катара. Мухаммад ибн Халифа Аль Халифа потерпел поражение от Абдаллы ибн Ахмада в битве при Аль-Насфе и вынужден был бежать в эмират Неджд, где находился при дворе саудовского правителя Абдаллы ибе Сунайяна[2].
В начале 1843 года Мухаммед вернулся в Катар, а затем в Бахрейн, а в апреле 1843 года он победил Абдаллу ибн Ахмада Аль Халифу, став следующим правителем Бахрейна[3]. Во время своего правления Мухаммед платил ежегодную дань Фейсалу ибн Турки, преемнику Абдаллы ибн Сунайяна как эмир Неджда. Однако в 1850 году он начал не платить сумму, и в следующем году Мухаммед попытался заручиться поддержкой османов, но его попытка не увенчалась успехом[4]. Абдалле ибн Фейсалу, сыну правителя Неджда, удалось достичь соглашения с Мухаммедом при посредничестве Саида ибн Тахнуна, шейха Абу-Даби.
Мухаммад Аль Халифа подписал договор с британцами в 1856 году, согласно которому он гарантировал, что он будет захватывать британские суда, перевозящие военнопленных на его территории, и запрещать его или его подданным суда от перевозки рабов[5] . В 1860 году Мухаммед обратился к Ирану за защитой из-за ограничений на его действия, наложенных британцами в связи с упомянутым выше договором, и его предложение было персами встречено, но не было реализовано[4][6]. Мухаммед и его брат Али были вынуждены британским резидентом, коммандером Феликсом Джонсом подписать конвенцию, и эта конвенция фактически интегрировала Бахрейн в Договорный Оман в 1861 году.
Мухаммад ибн Халифа Аль Халифа отрекся от престола в результате британской интервенции после предполагаемого нарушения конвенции 1861 года, которая запрещала ему совершать морские грабежи[3][7]. В 1867 году он и шейхи Абу-Даби напали на побережье Катара, что привело к большому ущербу в регионе, и этот инцидент ускорил его свержение британцами. Мухаммед бежал из Бахрейна в 1868 году и сначала отправился в Хор-Хасан в Катаре, а затем поселился в Катифе. Ему наследовал его брат Али бин Халифа Аль Халифа, который был убит по приказу Мухаммеда ибн Абдаллы Аль Халифы в 1869 году[3][8]. Британцы арестовали Мухаммеда и отправили его в тюрьму в Индии, где он находился в заключении в Бомбее (1869—1877) и Адене (1877—1887).
В 1888 году Мухаммед ибн Халифа Аль Халифа был освобожден из британской тюрьмы и доставлен в Мекку, где он жил до своей смерти в 1890 году[7].
У Мухаммада Аль Халифы от 12 жен было 24 сына и несколько дочерей: