Под его руководством были разработаны оригинальные методы извлечения и освоения золота и металлов платиновой группы и оформилось новое направление — наноминералогия.[2]
С 1952 по 1954 — прораб, рудничный геолог, старший геолог (с 1954 года) треста «Амурзолото».
С 1961 по 1964 — зав. Благовещенской лабораторией ДВГИ ДВФ СО АН СССР.
С 1964 года — зав. лабораторией эндогенных месторождений ДВГИ ДВФ СО АН СССР.
С 1969 года — зам. директора ДВГИ по науке.
С 1975 по 1979 — и. о. директора ДВГИ ДВНЦ АН СССР.
С 1979 года В. Г. Моисеенко принимал участие в организации Амурского комплексного научно-исследовательского института ДВНЦ АН СССР (г. Благовещенск) и был директором этого института со дня его основания до 2002 года[источник не указан 1794 дня].
Учёный в области геологии, минералогии и геохимии золоторудных месторождений. Изучал геохимию, условия рудообразования, минералогии и метаморфизма самородного золота, а также взаимосвязь глубинных флюидов, магматизма и рудообразования.
Теоретически доказал и экспериментально подтвердил оптимальные условия собирательной перекристаллизации этого металла с интенсивным укрупнением размеров его выделений. Именно эти результаты фундаментальных исследований, в том числе явления отрицательной диффузии золота, положены в основу принципиально нового метода извлечения благородных металлов из руд, упорных руд, концентратов и шлихов[4].
Новый подход в понимании рудного процесса и поведения золота в различных геологических условиях позволили коллективу учёных и геологов-производственников, возглавляемых В. Г. Моисеенко, провести переоценку ресурсов золота в Амурской области, считавшихся ранее малоперспективными. Это вывело Амурскую область на первое место в России по ресурсам россыпного золота и, начиная с 1984 года, определило наращивание его добычи. Под его руководством оформилось новое научное направление — наноминералогия: изучение особых свойств ультрадисперсных минеральных выделений и минералов со структурой кластеров. В итоге разработаны новые методы извлечения и освоения золота и платиноидов[источник не указан 1794 дня].
Под его научным руководством защитили диссертации 32 кандидата и 4 доктора наук[источник не указан 1794 дня].
Автор более 350 научных публикаций, в том числе 30 монографий (из них десять — авторские), около 40 патентов на изобретения[источник не указан 1794 дня].
