Якуб проиграл в финале Открытого чемпионата Австралии среди юниоров 2022 года Бруно Кузухаре.
В мае 2023 года чех выиграл свой первый «Челленджер», Открытый чемпионат Праги «Спарта 2023», победив Доминика Кёпфера в финале, и став самым молодым чемпионом из Чехии в истории «челленджера»[3].
Меншик выступил в квалификационном раунде Открытого чемпионата США по теннису 2023 года. Обыграв Фабио Фоньини, а затем Леандро Риди, Зденека Коларжа он впервые в карьере квалифицировался в основную сетку турнира Большого шлема. В первом раунде турнира он обыграл Грегуара Баррера, став самым молодым теннисистом после Борны Чорича в 2014 году, выигравшим матч основной сетки на Открытом чемпионате США[4]. Затем, во втором раунде, он победил молодого Титуана Дроге и только в третьем круге проиграл Тейлору Фрицу.
Якуб получил право сыграть в основной сетке турнире ATP 250, открытом чемпионате Катара 2024 года, по программе «молодой игрок». Сначала Меншик победил Алехандро Давидовича Фокина, затем переиграл Энди Маррея в трех сетах с тремя тай-брейками и вышел в свой первый четвертьфинал на турнирах ATP. В дальнейшем обыграл первого сеяного Андрея Рублева, а в полуфинале победил Гаэля Монфиса в трех сетах и вышел в свой первый финал ATP тура. В решающем поединке уступил Карену Хачанову со счётом 6-7(12-14) 4-6[6].
В апреле на турнире серии Masters в Мадриде обыграл во втором круге 10-ю ракетку мира Григора Димитрова в трёх сетах, но затем снялся в матче третьего круга против Феликса Оже-Альяссима. Не выступал на Открытом чемпионате Франции. На Уимблдоне в первом круге проиграл 23-й ракетке мира Александру Бублику со счётом 6-4 7-6(7-2) 4-6 4-6 2-6.
В конце июля дошел до полуфинала турнира ATP 250 в Умаге на грунте, уверенно выиграл три матча в двух сетах, но в полуфинале уступил 17-й ракетке мира Лоренцо Музетти (4-6 1-6). На летних Олимпийских играх в Париже без борьбы проиграл во втором круге американцу Томми Полу (3-6 1-6). 6 августа поднялся на высшее в карьере 64-е место в рейтинге.
На Открытом чемпионате США в первом круге разгромил 19-го сеянного Феликса Оже-Альяссима со счётом 6-2 6-4 6-2. В третьем раунде проиграл португальцу Нуну Боржешу, не реализовав несколько матчболов в 4-м сете.