Элайза Душку родилась в Уотертауне, штатМассачусетс. В настоящее время она проживает в Лорел-Каньоне, Лос-Анджелесе[2]. Она — дочь Филипа Р. Душку, албано-американского администратора и преподавателя в бостонских общественных школах, и его бывшей жены Джудит, университетского администратора и профессора в Саффолкском университете[3], которая является датчано-американкой по линии обоих дедушек и англо-американкой по линии её бабушек[4][5]. Душку посещала школу Beaver Country Day (дословный перевод — Национальный день бобра) в Chestnut Hill (дословный перевод — Каштановый холм) и будучи подростком окончила Уотертаунскую среднюю школу (штатМассачусетс). Мать Элайзы была мормонкой и часто брала дочь в церковь по воскресеньям, но сейчас Элайза не исповедует мормонизм[6]. У неё есть три старших брата: Аарон, Бенджамин (род. 5 февраля 1976), и Натан (род. 8 июня 1977, Бостон, Массачусетс), последний является моделью и актёром. Её родители развелись, когда она была ещё младенцем.
После этого Элайза взяла небольшой перерыв, чтобы окончить школу. Она была принята в Университет Джорджа Вашингтона в Вашингтоне и Саффолкский Университет в Бостоне, где её мать работает профессором.
После окончания средней школы Элайза вернулась на экраны в роли Фэйт в сериале «Баффи — истребительница вампиров». Изначально было запланировано всего пять эпизодов, в которых Душку появится в этой роли, но её персонаж стал настолько популярным, что она осталась в сериале до конца третьего сезона и потом ещё появилась в двух частях четвёртого сезона. И вернулась в конце 7 сезона для съёмок финала сериала.
В 2000 году Душку появилась в фильме «Добейся успеха» вместе с Кирстен Данст[7]. Фильм ожидал огромный успех и хорошие продажи на DVD, после последовало ещё 4 фильма-продолжения, выпущенных специально для DVD, но Элайза там уже не снималась. В 2001 годуКевин Смит пригласил Душку сняться в его комедии «Джей и Молчаливый Боб наносят ответный удар», в этом фильме она снялась с такими звездами как Шэннон Элизабет, Эли Лартер, Бен Аффлек и многими другими. В 2003 году Элайза снялась в фильме «Поворот не туда», где у неё уже была настоящая звездная роль. Начиная с 2003 года она начала сниматься в главной роли в сериале «Вернуть из мертвых», где она играла студентку Тру Дэвис, которую взяли на работу в морг, где она открывает в себе способность возвращаться назад во времени по зову умершего, и пытается помочь ему избежать смерти.
В 2001 году в интервью для журнала «Maxim» Душку сказала о своих ролях: «Легко играть плохую девочку: Ты только делаешь всё, что тебе до этого запрещали, и не думаешь о последствиях, только так это и выходит».
В 2008 году Элайза сыграла детектива Мэган Пейдж в триллере с элементами мистики «Алфавитный убийца» по мотивам реальных событий о серийном убийце в небольших городках штата Нью-Йорк. В целом картина и роль Душку получили негативные отзывы критиков.
В 2009 году Элайза вновь вернулась на телевидение в новый проект Джосса Уэдона «Кукольный дом». Сериал показывался по телеканалу «FOX» и продержался лишь два сезона.
Поначалу мне нравилось принимать наркотики, потому что мне нравилось то, как они заставляют меня себя чувствовать. Мне нравилось то, что с ними я могу ничего не чувствовать, да мне это было и не нужно. Было весело и я любила это до тех пор, пока это не перестало быть весело. Наркотики не любили меня, они не любили мою семью. Они определённо не любили моих друзей, которые умерли. Много моих друзей погибло от этого.
14 января 2018 года Душку заявила, что в 12-летнем возрасте она подверглась сексуальному домогательству постановщика трюков Джоэля Крамера, когда снималась в картине Джеймса Кэмерона «Правдивая ложь»[8][9].
С 18 августа 2018 года Душку замужем за предпринимателем и бывшим теннисистом Питером Паланджяном[англ.][10], от которого у неё есть два сына — Филип «Борн» Душку Паланджян (род. в июле 2019)[11] и Грегори Бодан «Боди» Душку Паланджян (род. август 2021)[12]. Также у неё есть четверо пасынков и падчериц: Манон, Петрос, Марго и Маделон.
