О происхождении и ранних годах жизни Фортуната II достоверных сведений в исторических источниках не сохранилось. Возможно, он родился в Риме[5].
В сентябре 591 года по неизвестным причинам папой римским Григорием I Великим был лишён сана епископ НеаполяДеметрий. Папа желал, чтобы Неаполитанскую епархию получил Павел, уже бывший тогда епископом города Непи. Однако такое самовластие Григория I вызвало среди неаполитанцев сначала недовольство, а затем и мятеж, из-за которого Павел в 592 году был вынужден покинуть город. Попытки Григория I добиться от знати и жителей Неаполя согласия на возвращение Павла, не увенчались успехом. Из-за этого епископская кафедра оставалась вакантной один год и три месяца. Только в 593 года новым главой Неаполитанской епархии был избран Фортунат II. Вероятно, он также был креатурой Григория I, и даже, возможно, был тем посвящён в епископский сан в Риме. Однако в отличие от Павла Непийского, новый неаполитанский епископ был с большой благосклонностью принят своей паствой[3][6][7][8].
Являясь близкой к Григорию I Великому персоной, Фортунат II неоднократно получал от папы римского важные поручения. В том числе, вместе с четырьмя другими епископами он участвовал в похоронах скончавшегося 14 декабря 596 года аббата Агнелла Неаполитанского, впоследствии причисленного к лику святых[6][9].
Из написанных осенью 598 года посланий Григория I Великого известно о конфликте Фортуната II с представителями городской знати. Его причиной был спор о принадлежности имущества, на которое претендовали как епископ, так и светские лица. Согласно письмам папы римского, Фортунат потребовал передать своей епархии несколько общественных зданий в Неаполе. Этому воспротивилась часть городской знати во главе с Феодором, который совершил поездку в Рим и добился от Григория I осуждения действий епископа. Более того, папа римский потребовал от Фортуната II возвратить и всё ранее присвоенное епископом городское имущество, поручив проконтролировать исполнение своего повеления византийскому военному магистру в КампанииМаврентию. Выполнил ли епископ папское предписание, неизвестно[3][4][10].
От преемника же Маврентия, дукса Кампании Гудескалька, Григорий I Великий в написанном между ноябрём 599 года и февралём 600 года послании требовал, чтобы этот военачальник возвратил неаполитанскому епископу монастырь Святого Архангела[итал.], конфискованный у епархии для военных нужд[11][12][13][14].
Фортунат II скончался в апреле или июле 600 года после семи лет и одиннадцати дней управления Неаполитанской епархией. Его преемником в епископском сане был Пасхазий[6][8].
↑Prosopographie chrétienne du Bas-Empire. 2. Prosopographie de l’Italie chrétienne (313—604) / Pietri Ch., Pietri L. — Roma: École française de Rome, 2000. — Vol. 2. — ISBN 978-2-7283-0613-8.
