В 1858 году Франциск Фоголла вступил во францисканский орден. 19 сентября1863 года Франциск Фоголла был рукоположён в священника. 13 декабря1866 года Франциск Фоголла был направлен на миссию в Китай. 24 августа1898 года, будучи в Китае, Франциск Фоголла был рукоположён в титулярного епископаБаги и назначен вспомогательным епископа-коадъютора апостольского викариата провинции Шаньси. В 1898 году, чтобы привлечь священнослужителей и монашествующих для работы на миссии в Китае, путешествовал по Европе со своим помощником Симоном Чэнь Симанем и четырьмя китайскими семинаристами (среди которых были Патрик Дун Боди и Иоанн Ван Жуй), рассказывая о деятельности Католической Церкви среди китайцев. Благодаря этому путешествию Франциск Фоголла смог найти материальные средства для обеспечения жизнедеятельности китайских миссий и привлечь для работы на миссиях несколько молодых священников и семь монахинь из конгрегации «Францисканки Миссионерки Марии».
Вскоре после их приезда в Китай, там в 1899 году началось ихэтуаньское восстание боксёров, во время которого со стороны повстанцев стали жестоко преследоваться христиане. Франциск Фоголла был арестован по приказу губернатора Шаньси Юй Сяня вместе с двумя другими епископами Григорием Марией Грасси и Элиасом Факкини, а также среди арестованных были три священника, семь монахинь, десять мирян.
9 июля1900 года Франциск Фоголла был казнён вместе с другими двадцатью шестью верующими.
