В 1917—1921 годах учился в Музыкальной академии Ференца Листа в Будапеште у Золтана Кодая, Лео Вайнера и Альберта Шиклоша (композиция), а в 1921—1923 годах — в Лейпцигском университете у Германа Аберта (музыковедение), и одновременно учился на филологическом факультете. Собирал старинные музыкальные рукописи, расшифровал и опубликовал ряд вокальных и инструментальных сочинений из старинных сборников. Выступал как музыкальный критик, в 1926—1929 годах был редактором музыкального журнала Zenei Szemle[венг.], а в 1930—1931 годах — главным редактором первого венгерского энциклопедического Музыкального словаря (венг.Zenei lexikon, с Аладаром Тотом и Яношем Бартой). Состоял членом редколлегий ведущих венгерских музыкальных журналов. С 1945 года — профессор кафедры истории музыки своей альма-матер. В 1961 году организовал Архив Бартока, реорганизованный в 1970 в Институт музыковедения Венгерской АН, которым руководил до 1973 года.
A XVI. század magyar históriás zenéje. A Hofgreff-énekeskönyv dallamainak kritikai kiadásával; Pallas, Bp., 1931 (Magyar zenei dolgozatok)
A magyar zene története rövid összefoglalásban a magyar zenetörténet irodalmának áttekintésével; Somló Béla, Bp., 1934 (Népszerű zenefüzetek)
Népvándorláskori elemek a magyar népzenében; Egyetemi Nyomda, Bp., 1935
Pótlás a zenei lexikonhoz; szerk. Szabolcsi Bence–Tóth Aladár; Győző Andor, Bp., 1935
Bevezetés a zenetörténetbe; Franklin, Bp., 1937 (Kultúra és tudomány)
Egyetemes művelődéstörténet és ötfokú hangsorok; Magyar Néprajzi Társaság, Karcag, 1937 (Az "Ethnographia" füzetei)
A zene története; Rózsavölgyi, Bp., 1940
Szabolcsi Bence–Tóth Aladár: Mozart élete és művei; Győző Andor, Bp., 1941
Daloskönyv az izraelita ifjúság számára. 174 magyar és héber dallam hangjegyével és szövegével; szerk. Káldi László, Szabolcsi Bence; Singer és Wolfner, Bp., 1942
Régi muzsika kertje. Kétezer év kínai, görög, latin, francia, angol, olasz, német, orosz, magyar irodalmából összeválogatta Szabolcsi Bence; Márk Tivadar rajzaival; Magyar Kórus, Bp., 1946
Beethoven. Művész és műalkotás két korszak határán. Hangjegypéldákkal; Új idők, Bp., 1947
A magyar zenetörténet kézikönyve; szerk. Szabolcsi Bence; Magyar Kórus, Bp., 1947 (A zenetörténet kézikönyvei)
A régi nagykultúrák dallamosság. Az ötfokúságtól a diatonáig; szerzői, Bp., 1947
Dolgozók hangversenykalauza; írta a Bartók Béla Szöv. munkás-karnagykézpő Iskolájának Munkaközössége; szerk. Szabolcsi Bence; Népszava, Bp., 1949
Európai virradat. A klasszikus zene kialakulása Vivalditól Mozartig; Új Idők, Bp., 1949
A melódia története. Vázlatok a zenei stílus múltjából; Cserépfalvi, Bp., 1950
A XVII. század magyar világi dallamai; Akadémiai, Bp., 1951
A XIX. század magyar romantikus zenéje. Hangjegyfüggelékkel; Zeneműkiadó, Bp., 1951
Adatok az új magyar népdalstílus történetéhez; szerzői, Bp., 1951
Arany János népdalgyűjteménye. Közzéteszi Kodály Zoltán, Gyulai Ágost; szerk. Szabolcsi Bence; Akadémiai, Bp., 1952
A művész és közönsége. Zeneszerző, társadalom és zenei köznyelv a polgári korszak küszöbén; Zeneműkiadó, Bp., 1952
Szabolcsi Bence: Bartók Béla élete; Bónis Ferenc: Bartók élete képekben; 2. bőv. kiad.; Zeneműkiadó, Bp., 1958
Bartók Béla megjelenése az európai zeneéletben. 1914-1926. Liszt Ferenc hagyatéka; szerk. Szabolcsi Bence, Bartha Dénes; Akadémiai, Bp., 1959 (Zenetudományi tanulmányok
Vers és dallam. Tanulmányok a magyar irodalom köréből; Akadémiai, Bp., 1959
A magyar zene évszázadai 1-2.; sajtó alá rend. Bónis Ferenc; Zeneműkiadó, Bp., 1959-1961
Zsidó kultúra és zenetörténet. Tanulmányok; sajtó alá rend. Kroó György, szerk. Komoróczy Géza, szöveggondozás és bibliográfia Wilheim András; Osiris–MTA Judaisztikai Kutcsoport, Bp., 1999 (Hungaria Judaica, 13.)
Szabolcsi Bence válogatott írásai; szerk. Wilheim András; Typotex, Bp., 2003