Учился в навигацкой школе в Москве, откуда в 1708 году был переведен волонтёром на флот. Через два года в 1710 году он был отправлен в Голландию для изучения морскому делу, плавал волонтёром на голландских военных кораблях до Португалии и находился в крейсерствах (разъезды военных кораблей по морю с целью захвата неприятельских торговых судов)[1][2]. В 1713 году П. К. Пушкин учился вместе с другими русскими дворянами в Амстердаме.
15 (26) декабря 1727 года получил чин капитана 3-го ранга. 4 (15) января 1728 года он был назначен помощником вице-адмиралаЯкоба Вильстера и директором Морской Академии. Командуя кораблем «Рафаил», он плавал в Киль и до 24 марта (4 апреля) 1730 года руководил Морской Академией. 19 (30) марта 1731 года П. К. Пушкин был произведен в капитаны 2-го ранга и уволен со службы, но в ноябре того же года был определен в Тавров «для лучшего отправления дел», где пробыл до 7 (18) ноября 1732 года[3].
В 1743 году Пётр Калинович Пушкин, будучи действительным статским советником, «назначен присутствовать» на суде по делу Лопухиных, уличённых в «замысле» и приговорённых, в итоге, к «колесованию и отрезанию языков»[3].
Веселаго Ф. Ф. Общий морской список от основания флота до 1917 г.. — СПб.: «Атлант», 2013. — Т. 1. — 544 с. — (Военно-историческая библиотека). — ISBN 978-5-906200-02-0.
Кирокосьян М. А. Русский флаг на Каспии: Два столетия Каспийской флотилии (середина XVII — середина XIX века); Пираты каспийского моря / Вступительное слово А. А. Жилкина. — М.: Военная книга, Кучково поле, 2013. — 416 с. — 2000 экз. — ISBN 978-5-9904362-3-7. — ISBN 978-5-9950-0352-6.