С 20 мая 1861 года вступил в исправление должностимирового посредника первого призыва по Княгининскому уезду. В 1864 году избран княгининским уездным предводители дворянства, а 18 декабря 1869 года — нижегородским губернским предводителем дворянства. Избран почётным мировым судьёй по Нижегородскому и Княгининскому уездам, а в 1869 году — председателем съезда мировых судей Нижегородского судебного мирового округа. 1 января 1871 года произведён в статские советники «за отличие». Кроме того, состоял почётным попечителем Нижегородской гимназии и Нижегородского дворянского института (1864—1870), а также Нижегородского приюта для призрения бедных дворян Нижегородской губернии. Избран почётным гражданином Княгинина.
Прутченко Михаил Борисович // Исторический сборник о нижегородских губернских предводителях дворянства 1785—1896 годов / Сост. Михаил Андреевич Зеленецкий. — Н. Новгород: Тип. У. А. Скирмунт, 1902. — С. 70—79.
Прутченко Михаил Борисович // Список гражданским чинам первых трех классов / Исправлен по 1-е октября 1885 года. — СПб., 1885. — С. 590—591.