Окончил философский факультет (1966) и аспирантуру (1971) МГУ им. М. В. Ломоносова. Работал ассистентом на кафедре философии Московского института народного хозяйства (1966—1968; 1972—1975), затем — старшим преподавателем, доцентом, заведующим кафедрой управления, деканом факультета экономики и управления Института повышения квалификации руководящих работников и специалистов Миннефтехимпрома СССР (1976—1984). С 1984 — в Институте философии АН СССР: старший научный сотрудник, ведущий научный сотрудник, заведующий сектором (с 1989), заведующий лабораторией (с 1992), руководитель Центра социально-философских исследований Института философии РАН. Работал в Академии славянской культуры (с 1992). Профессор, доктор философских наук, заведующий кафедрой теоретической политологии философского факультета МГУ им. М. В. Ломоносова (с 1989).
Кандидатская диссертация — «Критика социальной доктрины Жана Фурастье» (1974), докторская диссертация — «Современный цивилизационный процесс и феномен неоконсерватизма» (1991). Работы Панарина А. С. посвящены проблемам философии политики, философии культуры, философии истории, анализу зарубежных идеологических течений, современному реформационному процессу в России.
А. С. Панарин прошёл путь от либерального диссидента советских времён к русскому философу-патриоту эпохи рубежа тысячелетий. По мнению близкого друга и соратника А. С. Панарина, проф. В. Н. Расторгуева, мыслитель всю свою жизнь оставался в вынужденной оппозиции власти, ратуя за духовное и политическое возрождение России, русского народа.
А. С. Панарин подготовил более 250 научных работ, в том числе 18 крупных монографий, а также популярные учебники и пособия по политологии и политтехнологиям. Наиболее известные из них, принесшие Панарину известность и популярность — это «Политология», «Глобальное политическое прогнозирование», «Православная цивилизация в глобальном мире», «Агенты глобализма» (позднее эта работа целиком вошла в книгу «Искушение глобализмом», за которую учёный удостоился Солженицынской премии), и, наконец, «Стратегическая нестабильность в XXI веке».
Помимо книг, А. С. Панарин написал немало статей, реагируя на те или иные события: «В каком мире нам предстоит жить?» (геополитический прогноз, сделанный в 1997 году), «Наше ближайшее будущее безнадёжно устарело» (делается такой же прогноз — о глобальной гражданской войне богатых с бедными, загнанными в угол и вынужденными создавать силы глобальной самообороны), «Народ без элиты: между отчаянием и надеждой», «Онтология террора» (выступление на «круглом столе» в МГУ, организованном сразу же после терактов в Нью-Йорке, на котором Панарин выступил с мыслями, резко осуждающими встревание России в американские «антитеррористические» авантюры), наконец, статья в газете «Завтра», написанная к 50-летию со дня смерти И. В. Сталина — «О Державнике-Отце и либеральных носителях „эдипова комплекса“», в которой учёный сопоставляет стремление развенчать «культ личности» со стороны интеллигенции с фрейдистским комплексом «юноши Эдипа», бунтующего против фигуры Отца в патриархальной семье.
Наряду с западной цивилизацией Панарин выделяет мусульманскую, индо-буддийскую, конфуцианско-буддийскую и православную. Россия представляет собой православную цивилизацию, поэтому попытки западнических радикалов втянуть Россию в орбиту Запада он считает происками пятой колонны. Триумф Запада прикрывается апологетическим глобализмом, рупором которого был Римский клуб. В основе западной цивилизации Панарин видит социал-дарвинизм. В целом принцип цивилизации означает полиэтничность. Смысл православия сводится к греческому, восточно-христианскому исповеданию и святоотеческому наследию Иоанна Златоуста, Василия Великого и Григория Богослова, а также идеалу священного царства, основанный на высшей правде. По отношению к России Византия является материнской цивилизацией. Моисеем русского народа Панарин называет Андрея Боголюбского.
Политический мир на Востоке и на Западе. М., 1998;
Россия в циклах мировой истории (1999);
Глобальное политическое прогнозирование в условиях стратегической нестабильности. — М.: Эдиториал УРСС, 1999. — 272 с. — 2000 экз. — ISBN 5-8360-0027-1.
Политология. О мире политики на Востоке и на Западе. — Изд-во: Университет, 2000. — 320 с. — ISBN 5-8013-0091-0.
Российская альтернатива. Нью-Йорк, 2000;
Искушение глобализмом. М., 2000;
Политология: Аналитика и прогностика. М., 2000;
Политология: западная и восточная традиции. М., 2000;
Россия в Евразии: геополитические вызовы и цивилизационные ответы // Вопросы философии. 1994. № 12
Православная цивилизация в глобальном мире // Москва. 2001. № 1-10
Постмодернизм и глобализация: Проект освобождения собственников от социальных и национальных обязательств // Вопросы философии. 2003. № 6
Антропология политическая, Деидеологизация, Философия политик, Финализм исторический, Человек политический и др. // Философия: Энциклопедический словарь. М., 2006.
↑«за книги „Реванш истории“ (1998) и „Искушение глобализмом“ (2000) с их глубоким осмыслением нового мирового порядка, места в нём России и её ценностного самостояния»
↑ 12Сборники статей «Народ без элиты» и «Правда железного занавеса» выпущены издательством «Алгоритм» после смерти А. С. Панарина с нарушениями авторского права. В 2007 году Мосгорсуд признал эти книги контрафактными и подлежащими уничтожению.