В 1936 году на месте будущего посёлка был устроен перевалочный пункт для грузов, завозимых в Якутию по Севморпути. В 1954 году было начато строительство крупного речного порта. При этом для работы в новом порту в течение 10 последующих лет переселяли речников из Янска. Посёлок превратился в крупный транспортный узел для снабжения Усть-Янского и Верхоянского районов Якутии и материально-технического обеспечения Депутатского ГОКа[3].
В 1996 году из Нижнеянска в Усть-Куйгу перевели управление Янским речным пароходством, после чего начался упадок посёлка. С 1989 года население посёлка упало более чем в 10 раз. В настоящее время состояние посёлка остаётся крайне неудовлетворительным и даже катастрофическим[4]. По словам журналистки Маргариты Нифонтовой, на 2022 год 90% жилого фонда посёлка находится в аварийном состоянии, в посёлке отсутствуют полиция, пожарная часть, медицинская помощь осуществляется лишь путём сообщения с улусным центром[5][6]. При этом в посёлке отсутствует безработица, был зарегистрирован лишь один безработный. Порт Нижнеянска остаётся важным стратегическим узлом для речного сообщения с Северо-Восточной Якутией[4][6]. Будущее возрождение поселка, в первую очередь, связывают с промышленным освоением полезных ископаемых, в частности, с разработкой месторождения золота Кючус и со строительством АЭС малой мощности.
Аэропорт
На правом берегу реки Яна расположен «Аэропорт Нижнеянск», который входит в структуру Федерального казённого предприятия «Аэропорты Севера». Принимаемые воздушные суда: Ан-24, Ан-26, L-410, Ан-2, Ан-3, вертолёты всех типов. Взлётно-посадочная полоса грунтовая, длина составляет 1700 м. В период весеннего паводка аэропорт затопляется выходящей из берегов рекой, в это время возможна посадка только вертолётов.
Ранее выполнялись регулярные рейсы авиакомпаний «Якутия» и «Полярные авиалинии». По состоянию на 2012 год, из-за нерентабельности регулярные рейсы не осуществляются.
↑[[Усть-Янский улус]]. Административный центр муниципального образования посёлок Нижнеянск Усть-Янского улуса — пгт Нижнеянск (неопр.). http://www.sitc.ru/. СИТК (26 июля 2000). — Информация поступила в Центр социально-экономического и политического мониторинга 26 июля 2000 года. Дата обращения: 20 августа 2022. Архивировано из оригинала 2 февраля 2012 года.
[[Усть-Янский улус]]. Административный центр муниципального образования посёлок Нижнеянск Усть-Янского улуса — пгт Нижнеянск (неопр.). http://www.sitc.ru/. СИТК (26 июля 2000). — Информация поступила в Центр социально-экономического и политического мониторинга 26 июля 2000 года. Дата обращения: 20 августа 2022. Архивировано из оригинала 2 февраля 2012 года.